Diferença chave – Proteômica vs Transcrição
A tecnologia ômica é uma tendência atual, onde as diferentes biomoléculas de um organismo são vistas como um conjunto completo no que diz respeito às suas propriedades e funções. A tecnologia ômica tem uma ampla gama de aplicações. As diferentes ômicas de uma amostra biológica incluem genômica, proteômica, transcriptômica e metabolômica. A proteômica envolve o estudo completo de todas as proteínas em um organismo vivo. É definido como o conjunto de todas as proteínas expressas em um organismo, suas propriedades estruturais e funcionais. O conjunto completo de proteínas, portanto, forma o proteoma. A transcriptômica é o estudo completo de todas as moléculas de RNA mensageiro (mRNA) presentes em um organismo vivo. Assim, a transcriptômica lida com os genes que são expressos ativamente em um organismo vivo. O conjunto total de mRNA em um organismo vivo é referido como o transcriptoma. A principal diferença entre proteômica e transcriptômica é baseada no tipo de biomolécula. Na proteômica, estuda-se o conjunto total de proteínas expressas em um organismo vivo, enquanto, na transcriptômica, estuda-se o mRNA total de um organismo vivo.
O que é Proteômica?
O termo proteômica foi cunhado no ano de 1995 e foi inicialmente definido como o complemento proteico total em uma célula, tecido ou organismo. Com o avanço nos estudos proteômicos, foi então modificado para ser considerado como um termo guarda-chuva no qual muitos campos de estudo foram incluídos. Atualmente, sob o tema proteômica, estuda-se a estrutura, orientação, funções, suas interações, suas modificações, suas aplicações e a importância das proteínas. Portanto, muitas pesquisas são conduzidas no campo da proteômica atualmente.
Os primeiros estudos proteômicos foram feitos para identificar o conteúdo proteico em Escherichia coli. O mapeamento do teor de proteína total foi feito usando géis bidimensionais (2D). Após o sucesso disso, os cientistas passaram a caracterizar o conteúdo total de proteínas em animais como cobaias e camundongos. Atualmente, o mapeamento de proteínas humanas é feito usando eletroforese em gel 2D.
Aplicações da Proteômica
Há muitas vantagens em estudar a proteômica, pois as proteínas são as moléculas governantes da maior parte da atividade devido à propriedade catalisadora das proteínas. Assim, o estudo de proteínas inteiras pode fornecer informações sobre o estado de saúde de um organismo. Algumas aplicações são;
- Anotação do genoma: Ao estudar o conteúdo proteico de um organismo, os genomas exatos responsáveis pelo composto protéico ativo podem ser determinados. Neste cenário, os resultados de toda genômica, transcriptômica e proteômica são importantes.
- Identificação da doença/Diagnóstico: A proteômica é usada na identificação da condição da doença, comparando o saudável e o doente
- Para realizar a expressão da proteína estudada durante a experimentação.
- Modificações de proteínas e estudos de interação: Para usar proteínas em condições in vitro ou in vivo, decidir as condições de armazenamento dessas proteínas extraídas e estudar o comportamento da proteína in vitro, in vivo e in vivo – métodos silico.
Figura 01: Proteômica
Existem diferentes técnicas envolvidas na proteômica
- Extração da proteína total e separação das proteínas usando eletroforese em gel 2D. As proteínas também podem ser separadas por cromatografia líquida de alto desempenho (HPLC).
- Sequenciamento das proteínas extraídas usando métodos como o método de sequenciamento de Edmund ou espectrometria de massa.
- Uma vez que as sequências são identificadas, as propriedades estruturais e funcionais do conteúdo de proteína são analisadas usando software baseado em computador e ferramentas de bioinformática.
O que é Transcrição?
O termo transcriptoma foi cunhado recentemente. A transcriptômica é o estudo do conteúdo total de mRNA de um organismo. O mRNA total é o DNA expresso em um organismo vivo ou uma célula. A coleção completa de mRNA é chamada de transcriptoma.
Os passos para analisar o transcriptoma incluem,
- Extração de RNA, separação de mRNA usando cromatografia em coluna de gel com esferas poli DT.
- O sequenciamento do mRNA é feito.
A tecnologia de microarrays é uma maneira comum de identificar o transcriptoma de um organismo. A técnica de microarray envolve uma placa de sonda com as fitas complementares do transcriptoma. Após a hibridização, o mRNA presente no organismo ou células pode ser caracterizado.
Figura 02: Técnicas de Transcrição
Transcritômica agora é amplamente utilizada na área médica. O diagnóstico de doenças e o perfil de doenças são os principais campos em que a transcriptômica é usada. Ao analisar um transcriptoma de um organismo, o mRNA estranho pode ser identificado e, se houver alguma infecção, ele pode ser identificado. O RNA não codificante pode ser separado usando tecnologias transcriptômicas. E também a expressão de genes sob diferentes estresses ambientais pode ser monitorada.
Quais são as semelhanças entre proteômica e transcriptômica?
- Ambos fazem parte do conceito de tecnologia ômica.
- Ambos são usados no diagnóstico de doenças e caracterização de doenças de um organismo.
- Ambas as áreas de estudo envolveram a extração da biomolécula, separação da biomolécula e etapas de sequenciamento.
Qual é a diferença entre proteômica e transcriptômica?
Protemics vs Transcriptomics |
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| Proteômica envolve o estudo completo de todas as proteínas em um organismo vivo. | Transcritômica é o estudo completo de todas as moléculas de RNA mensageiro (mRNA) presentes em um organismo vivo. |
| Estudado Bio Molécula Tipo | |
| Proteínas são estudadas em proteômica. | mRNA são estudados em transcriptômica. |
| Fatores estudados | |
| Estrutura, função, interações, modificações e aplicações das proteínas são estudadas em proteômica. | Estrutura da sequência, interações com o ambiente e aplicações do mRNA são estudadas em transcriptômica. |
Resumo – Proteômica vs Transcrição
Omics desempenham um papel importante no campo das ciências da vida. Proteômica refere-se ao estudo do proteoma que forma as coleções completas de proteínas em uma célula ou organismo. A transcriptômica refere-se ao estudo do transcriptoma que é o conjunto completo de DNA expresso que está na forma de mRNA. As duas áreas de estudo, proteômica e transcriptômica, foram derivadas após a introdução da genômica e atualmente amplamente utilizadas em diagnósticos médicos e na caracterização e triagem de organismos. Esta é a diferença entre proteômica e transcriptômica.
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