A principal diferença entre o perfil de polissomo e o perfil de ribossomo é que o perfil de polissomo analisa o comportamento do ribossomo usando ribossomo e mRNA (polissomo) durante a tradução, enquanto o perfil de ribossomo analisa o comportamento do ribossomo apenas usando a sequência de mRNA durante a tradução.
Tradução é a segunda fase da síntese de proteínas que converte a informação do mRNA em uma sequência de aminoácidos. A translatômica é um estudo de ORFs (quadros de leitura abertos) que são traduzidos ativamente em uma célula de um organismo. As técnicas de perfil de polissomo e ribossomo são dois tipos de técnicas no campo da biologia molecular para avaliar e inferir diferentes parâmetros no contexto da análise do translatome.
O que é Perfil Polissômico?
Polysome profiling é uma técnica que infere o status da tradução de um mRNA específico, analisando o comportamento do ribossomo e do mRNA (polissoma). Em outras palavras, esta técnica fornece dados e conclusões sobre a associação de mRNAs com ribossomos. O polissoma refere-se ao grupo de ribossomos ligados a um mRNA que está presente durante a fase de alongamento da tradução.
Figura 01: Perfil polissômico
A criação de perfil de polissomo requer o lisado celular, que é então centrifugado. A amostra centrifugada é então separada com base em suas densidades para caracterizar as subunidades pequenas e grandes dos ribossomos e o mRNA correspondente envolvido na formação do polissoma. Além disso, o processo também envolve a medição da densidade óptica. Especialistas são obrigados a realizar perfis polissômicos.
A técnica de perfil polissômico é uma ferramenta importante para muitas aplicações. Os cientistas usam essa técnica para estudar o grau de tradução nas células. Mais especificamente, é uma ferramenta para fornecer informações precisas sobre o estudo de proteínas individuais e seus mRNAs específicos. No contexto de estudar o grau de tradução de um mRNA particular, a técnica de perfil de polissoma é vital. Aqui, as sequências 3' e 5' de um mRNA podem ser investigadas com referência aos seus efeitos sobre a quantidade de mRNA produzida e o nível de tradução.
O que é o perfil de ribossomo?
Ribosome profiler é uma técnica que analisa o comportamento do ribossomo em relação ao seu mRNA durante a tradução. Esta técnica foi encontrada e desenvolvida por Joan Steitz e Marilyn Kozak. Mais tarde, essa tecnologia foi desenvolvida por dois cientistas, Nicholas e Jonathan, em combinação com o sequenciamento de última geração, o que levou ao desenvolvimento de diferentes técnicas relacionadas, como a metodologia Translating Ribosome Affinity Purification (TRAP).
Figura 02: Sequenciamento de ribossomos
O procedimento de perfilamento de ribossomos envolve isolar o mRNA, remover o RNA que não está ligado aos ribossomos e separar o mRNA ligado aos ribossomos. Após este procedimento, o isolado de mRNA é transcrito de forma reversa e ocorre a síntese de cDNA. Finalmente, os dados da sequência podem ser alinhados com o perfil de tradução para deduzir as características do comportamento do ribossomo em relação ao mRNA.
O perfil de ribossomos ajuda muitos pesquisadores a identificar e inferir a localização dos locais de início da tradução, o complemento de quadros de leitura aberta (ORFs) traduzidos em uma célula ou tecido, a distribuição de ribossomos no mRNA e a taxa de traduzindo ribossomos. O perfil de ribossomo também é conhecido como pegada de ribossomo ou Ribo Seq.
Quais são as semelhanças entre o perfil polissômico e o perfil ribossomo?
- Perfil de polissomos e ribossomos são técnicas de biologia molecular importantes na pesquisa.
- Eles fornecem informações sobre o processo de tradução.
- Ambos os processos de criação de perfil fornecem dados através da análise do tradutor.
- Especialistas profissionais são necessários para realizar ambas as técnicas para obter resultados precisos.
- As ferramentas de bioinformática desempenham um papel importante em ambas as técnicas.
Qual é a diferença entre perfil polissômico e perfil ribossomo?
O perfil de polissomo analisa o comportamento do ribossomo usando ribossomo e mRNA (polissomo) durante a tradução, enquanto o perfil de ribossomo analisa o comportamento do ribossomo apenas usando a sequência de mRNA durante a tradução. Assim, esta é a principal diferença entre o perfil de polissomo e o perfil de ribossomo. Além disso, o perfil de polissomas envolve técnicas como centrifugação de gradiente de densidade e medições de densidade óptica, enquanto o perfil de ribossomo envolve extração de mRNA e técnicas de sequenciamento. Além disso, o perfil de ribossomo é mais preciso do que o perfil de polissomo.
O infográfico abaixo apresenta as diferenças entre perfis de polissomos e ribossomos em forma de tabela para comparação lado a lado.
Resumo – Perfil Polissômico vs Perfilamento Ribossomo
Tradução é a segunda fase da síntese de proteínas que envolve a conversão da informação da sequência de mRNA em uma sequência de aminoácidos. Esse processo requer um molde de mRNA, ribossomos, aminoácidos, tRNA e outros fatores. O perfil de polissomo e ribossomo são duas técnicas moleculares. O perfil de polissomo analisa o comportamento do ribossomo usando ribossomo e mRNA (polissomo) durante a tradução, enquanto o perfil de ribossomo analisa o comportamento do ribossomo usando apenas a sequência de mRNA durante a tradução. O perfil de polissomas envolve técnicas como centrifugação em gradiente de densidade e medições de densidade óptica. O perfil do ribossomo envolve técnicas como extração de mRNA, síntese de cDNA e sequenciamento. Então, isso resume a diferença entre perfil de polissomo e perfil de ribossomo.
