A principal diferença entre similaridade e identidade no alinhamento de sequência é que similaridade é a semelhança (semelhança) entre duas sequências em comparação, enquanto identidade é o número de caracteres que correspondem exatamente entre duas sequências diferentes.
Bioinformática é um campo interdisciplinar da ciência que envolve principalmente biologia molecular e genética, ciência da computação, matemática e estatística. Alinhamento de sequências é um termo importante em bioinformática. É o procedimento no qual as sequências de DNA, RNA ou proteína são arranjadas para identificar regiões de semelhança que é consequência da relação funcional, estrutural ou evolutiva entre as sequências. Ao final do alinhamento, elas serão apresentadas como linhas dentro de uma matriz. Para alinhar os caracteres idênticos em cores sucessivas, espaços inseridos estão presentes entre os resíduos.
O que é Similaridade?
Semelhança no alinhamento de sequências é a semelhança entre duas sequências quando comparadas. Este fato é dependente da identidade das sequências. A similaridade descreve a extensão em que os resíduos estão alinhados. Assim, sequências semelhantes contêm propriedades semelhantes. Em bioinformática, a similaridade é uma ferramenta para avaliar a semelhança entre duas proteínas.
Figura 01: Semelhança no Alinhamento de Sequência
Existem duas etapas principais para o processo de alinhamento de sequência. A etapa inicial é o alinhamento de pares, que ajuda a encontrar o alinhamento ideal entre duas sequências (incluindo lacunas) usando algoritmos como BLAST, FastA e LALIGN. O algoritmo de correspondência encontra o número mínimo de operações de edição; in-dels e substituições para alinhar uma sequência à outra. Após o alinhamento par a par, é necessário obter dois parâmetros quantitativos de cada comparação par a par. Eles são identidade e semelhança.
O que é Identidade?
Identidade no alinhamento de sequência é o número de caracteres que correspondem exatamente entre duas sequências diferentes. Assim, as lacunas não contam na avaliação da identidade. A medição é considerada relacional à sequência mais curta entre as duas sequências. Significa significativamente que tem o efeito onde a identidade de sequência não é transitiva. Se X=Y e Y=Z, então X não é necessariamente igual a Z. Isso é deduzido em termos da medida da distância de identidade.
Figura 02: Identidade no Alinhamento de Sequência
Por exemplo, X tem uma sequência de AAGGCTT, Y tem uma sequência de AAGGC e Z tem uma sequência de AAGGCAT. A identidade entre X e Y é 100% {5 nucleotídeos idênticos / min[comprimento(X), comprimento(Y)]}. A identidade entre Y e Z também é 100%. Mas a identidade entre X e Z é de apenas 85% {(6 nucleotídeos idênticos / 7)}.
Quais são as semelhanças entre semelhança e identidade no alinhamento de sequência?
- Semelhança e identidade são dois termos que usamos no alinhamento de sequências.
- Além disso, eles se referem à semelhança entre as duas sequências.
- Além disso, nós os expressamos como um valor percentual.
Qual é a diferença entre semelhança e identidade no alinhamento de sequência?
A semelhança no alinhamento informa a semelhança entre duas sequências quando comparadas, enquanto a identidade no alinhamento da sequência informa a quantidade de caracteres que correspondem exatamente entre duas sequências diferentes. Portanto, esta é a principal diferença entre similaridade e identidade no alinhamento de sequência.
Resumo – Semelhança vs Identidade no Alinhamento de Sequência
O alinhamento de sequências ajuda a identificar regiões de semelhança no DNA, RNA ou proteína resultantes da relação funcional, estrutural ou evolutiva entre as sequências. Assim, semelhança e identidade são dois termos-chave no contexto do alinhamento de sequências. A principal diferença entre esses dois termos é que a semelhança é a semelhança entre duas sequências em comparação, enquanto a identidade é o número de caracteres que correspondem exatamente entre duas sequências diferentes. Assim, este é o resumo da diferença entre similaridade e identidade no alinhamento de sequências.
