Qual é a diferença entre MLVA e MLST

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Qual é a diferença entre MLVA e MLST
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Vídeo: Qual é a diferença entre MLVA e MLST

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Anonim

A principal diferença entre MLVA e MLST é que MLVA usa o polimorfismo de sequências de DNA repetidas em tandem para caracterizar espécies microbianas, enquanto MLST usa o polimorfismo de sequências de DNA de fragmentos internos de múltiplos genes de manutenção para caracterizar espécies microbianas.

A tipagem microbiana é normalmente usada para determinar a origem e as rotas de infecções. Confirma ou exclui surtos. A tipagem microbiana também rastreia a transmissão cruzada de patógenos associados à saúde e reconhece cepas virulentas. Além disso, a tipagem microbiana avalia a eficácia das medidas de controle de espécies microbianas patogênicas. MLVA e MLST são duas técnicas de biologia molecular usadas na tipagem microbiana.

O que é MLVA?

A análise VNTR de múltiplos loci (MLVA) é um método de biologia molecular que usa o polimorfismo de sequências de DNA repetidas em tandem para caracterizar espécies microbianas. É um método usado para a análise genética de espécies microbianas particulares.

Durante a primeira etapa de MLVA, cada locus VNTR alvo é amplificado por PCR com primers específicos da região flanqueadora. Em seguida, os fragmentos obtidos são separados por tamanho por eletroforese em um sequenciador capilar. A genotipagem de cada locus e os resultados compilados de cada amostra permitem caracterizar um microrganismo cuja espécie é conhecida. Também permite identificar a subespécie através da tipagem de alelos e comparação com as bases de dados MLVA.

MLVA vs MLST em formato tabular
MLVA vs MLST em formato tabular

Figura 01: MLVA

Este método MLVA é mais seletivo que o método MLST. Além disso, o método MLVA não requer uma etapa de sequenciamento de DNA. Assim, torna possível diferenciar subespécies próximas ou espécies clonais.

O que é MLST?

Multilocus sequence tiping (MLST) é uma técnica que utiliza o polimorfismo de sequências de DNA de fragmentos internos de múltiplos genes de manutenção para caracterizar espécies microbianas. MLST é uma técnica em análise genética para a tipagem de múltiplos loci.

MLVA e MLST - Comparação Lado a Lado
MLVA e MLST - Comparação Lado a Lado

Figura 02: MLST

É um tipo de tipagem de sequenciamento utilizado como técnica de referência para distinguir diferentes linhagens de espécies microbianas. Este método é baseado no sequenciamento de genes de manutenção. Os genes de manutenção normalmente codificam proteínas essenciais de agentes microbianos, como uma bactéria. Estas sequências de genes housekeeping têm a particularidade de apresentar um polimorfismo estável ao longo do tempo. Portanto, as diferenças nas sequências de genes de manutenção são suficientes para distinguir cepas umas das outras. Além disso, o primeiro esquema MLST a ser desenvolvido foi Neisseria meningitidis, o agente causador da meningite meningocócica e septicemia. Desde a sua introdução, o MLST tem sido usado não apenas para patógenos humanos, mas também para patógenos de plantas.

Quais são as semelhanças entre MLVA e MLST?

  • MLVA e MLST são duas técnicas de biologia molecular usadas na tipagem microbiana.
  • Ambas as técnicas podem ser usadas para análise filogenética microbiana.
  • Ambas as técnicas são baseadas em polimorfismo genético.
  • Eles podem ser usados para a detecção de doenças humanas que causam patógenos microbianos.
  • Ambas as técnicas devem ser realizadas por biólogos moleculares habilidosos.

Qual é a diferença entre MLVA e MLST?

MLVA é uma técnica que utiliza o polimorfismo de sequências de DNA repetidas em tandem para caracterizar espécies microbianas. Enquanto isso, MLST é uma técnica que utiliza o polimorfismo de sequências de DNA de fragmentos internos de múltiplos genes de manutenção para caracterizar espécies microbianas. Assim, esta é a principal diferença entre MLVA e MLST. Além disso, o método MLVA é mais seletivo que o método MLST.

O infográfico abaixo apresenta as diferenças entre MLVA e MLST em forma de tabela para comparação lado a lado.

Resumo – MLVA vs MLST

MLVA e MLST são duas técnicas de biologia molecular usadas na tipagem microbiana. MLVA usa o polimorfismo de sequências de DNA repetidas em tandem para caracterizar espécies microbianas, enquanto MLST usa o polimorfismo de sequências de DNA de fragmentos internos de múltiplos genes de manutenção para caracterizar espécies microbianas. Então, esta é a principal diferença entre MLVA e MLST.

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