A principal diferença entre LINEs e SINEs é que LINEs (elementos nucleares longos intercalados) são um tipo de retrotransposons não LTR mais longos, enquanto os SINEs (elementos nucleares intercalados curtos) são um tipo de retrotransposons não LTR muito mais curtos.
Os retrotransposons não LTR não contêm repetições terminais longas (LTR). No entanto, eles contêm genes para transcriptase reversa, proteína de ligação ao RNA, nuclease e domínio H da ribonuclease. Os retrotransposons não LTR têm repetições curtas. Essas repetições têm uma ordem invertida de bases próximas umas das outras. Além disso, retrotransposons não LTR também possuem repetições diretas encontradas em transposons LRT. Retrotransposons não LTR se enquadram em duas categorias como LINEs e SINEs.
O que são LINHAS?
LINEs (elementos nucleares longos intercalados) são retrotransposons não LTR mais longos. Eles são comuns nos genomas de eucariotos. Eles geralmente compõem 21,1% do genoma humano. Cada LINE tem cerca de 7.000 pares de bases. LINEs podem transcrever em mRNA e traduzir em uma proteína que pode funcionar como uma enzima transcriptase reversa. Esta transcriptase reversa produz cópias de DNA do RNA LINEs. Essas cópias de DNA podem ser integradas ao genoma em um novo local.
Figura 01: LINHAS e SENOS
O genoma humano possui apenas uma LINHA abundante chamada LINHA-1. O elemento LINE-1 tem cerca de 6000 pares de bases. Existem cerca de 100.000 elementos LINE-1 truncados no genoma humano. Mutação aleatória pode ocorrer em LINEs. Devido a mutações aleatórias, as LINEs podem degenerar. Eles não são mais transcritos ou traduzidos. Além disso, as LINEs são agrupadas em cinco grupos principais, como L1, RTE, R2, I e jockey. Esses cinco grupos subdividem-se em outros 28 clados.
LINEs são normalmente propagadas através de um mecanismo chamado mecanismo de transcrição reversa com preparação de alvo (TPRT). A inserção de LINEs causa doenças humanas como hemofilia A, câncer, distúrbios mendelianos, etc. A hipometilação de LINEs também desencadeia certos tipos de câncer.
O que são SINEs?
SINEs (elementos nucleares intercalados curtos) são um tipo de retrotransposons não LTR muito mais curtos. Eles têm cerca de 100 a 700 pares de bases de comprimento. Os SINEs também são elementos de DNA que se amplificam ao longo dos genomas eucarióticos por meio de intermediários de RNA. Os SINEs representam cerca de 13% do genoma dos mamíferos. As regiões internas dos SINEs originam-se do tRNA. Permanece altamente conservado. Eles estão frequentemente presentes em muitas espécies de vertebrados e invertebrados. A variação do número de cópias e as mutações nos SINEs podem ser incorporadas para construir a classificação das espécies baseada na filogenia.
SINEs podem ser agrupados em três tipos principais: CORE-SINEs, V-SINEs e AmnSINEs. O elemento Alu é o SINE mais comum em primatas. Além disso, existem mais de 50 doenças humanas associadas à inserção dos SINEs. Quando se inserem dentro ou perto de exons, podem causar emendas impróprias ou alterar o quadro de leitura. Isso leva a fenótipos de doenças como câncer de mama, câncer de cólon, leucemia, hemofilia, fibrose cística, câncer de cólon, doença de Dent, neurofibromatose, etc.
Quais são as semelhanças entre LINEs e SINEs?
- LINEs e SINEs são dois tipos de retrotransposons não LTR.
- Ambos não possuem regiões terminais longas (LTR).
- Ambos são predominantemente encontrados apenas em eucariotos.
- Ambos não são autônomos.
Qual é a diferença entre LINEs e SINEs?
LINEs são retrotransposons não LTR mais longos, enquanto os SINEs são retrotransposons não LTR muito mais curtos. Então, esta é a principal diferença entre LINEs e SINEs. Além disso, LINES codifica a enzima transcriptase reversa, enquanto SINE não codifica a enzima transcriptase reversa. Assim, esta é outra diferença entre LINEs e SINEs.
Mais diferenças entre LINEs e SINEs estão listadas abaixo em forma de tabela para comparação lado a lado.
Resumo – LINHAS vs SINEs
Retrotransposons são encontrados principalmente em todos os eucariotos, mas ausentes em procariontes. Aproximadamente, 37% do genoma humano contém retrotransposons. Os retrotransposons são principalmente dois tipos: retrotransposons LTR e Non-LTR. Os retrotransposons não LTR não contêm repetições terminais longas (LTR), que estão presentes nos retrotransposons LTR. Os retrotransposons não LTR são divididos em duas categorias: LINEs e SINEs. Os LINEs são retrotransposons não LTR mais longos, enquanto os SINEs são retrotransposons não LTR muito mais curtos. Assim, este é o resumo da diferença entre LINEs e SINEs.
