A principal diferença entre retrotransposons LTR e não LTR é que os retrotransposons LTR são um tipo de retrotransposons que possuem repetições terminais longas em sua estrutura, enquanto os retrotransposons não LTR são um tipo de retrotransposons que não possuem repetições terminais longas em sua estrutura.
Retrotransposons (elementos transponíveis de classe I ou transposons via intermediários de RNA) são um tipo de componente genético que pode copiar e colar-se em diferentes locais genômicos. Eles realizam isso convertendo RNA de volta em DNA através de um processo chamado transcrição reversa usando um intermediário de transposição de RNA. Existem dois tipos principais de retrotransposons como retrotransposons LTR e não-LTR
O que são Retrotransposons LTR?
LTR retrotransposons são um tipo de retrotransposons que possuem longas repetições terminais em sua estrutura. Longas cadeias de DNA repetitivo podem ser encontradas em cada extremidade de um retrotransposon LTR. Estes são conhecidos como repetições terminais longas (LTR). Cada LTR tem algumas centenas de pares de bases. Os retrotransposons LTR geralmente têm mais de 5 kilobases de comprimento. Além disso, entre as repetições terminais longas, existem genes que podem ser transcritos equivalentes aos genes de retrovírus gag e pol. Esses genes se sobrepõem de modo que codificam uma protease que normalmente processa o transcrito resultante em produtos gênicos funcionais.
Figura 01: Retrotransposons LTR
O gene Gag de retrotransposons produz um produto que se associa a transcrições de outros retrotransposons para formar partículas semelhantes a vírus. O gene Pol produz produtos que incluem enzimas como os domínios H da transcriptase reversa, integrase e ribonuclease. A enzima transcriptase reversa realiza a transcrição reversa do DNA do retrotransposon. A enzima integrase integra o DNA do retrotransposon no DNA do genoma eucariótico. Os domínios ribonuclease H são úteis na clivagem de ligações fosfodiéster entre intermediários de RNA. Os retrotransposons LTR também codificam transcritos com sítios de ligação de tRNA para que possam sofrer transcrição reversa com bastante facilidade. Além disso, como o retrotransposon contém informações do genoma eucariótico, ele pode inserir cópias de si mesmo em outros locais genômicos dentro de uma célula eucariótica.
O que são retrotransposons não LTR?
Os retrotransposons não LTR são um tipo de retrotransposons que não possuem repetições terminais longas em sua estrutura. Como os retrotransposons LTR, os retrotransposons não LTR também contêm genes para transcriptase reversa, proteína de ligação a RNA, nuclease e, às vezes, domínios H de ribonuclease. Mas eles não têm as longas repetições terminais; em vez disso, eles têm repetições curtas que podem ter uma ordem invertida de bases próximas umas das outras. As proteínas de ligação ao RNA ligam-se ao intermediário de transposição do RNA e as nucleases quebram as ligações fosfodiéster entre nucleotídeos em ácidos nucleicos.
Figura 02: Retrotransposons LTR e Não LTR
Embora sejam retrotransposons, eles não podem realizar a transcrição reversa usando um intermediário de RNA da mesma forma que os retrotransposons LTR. Isso ocorre porque os retrotransposons não LTR não contêm sequências que se ligam ao tRNA. Assim, um retrotransposon não LTR transcrito em mRNA e traduzido em proteínas atua como transcriptase reversa. A transcriptase reversa faz uma cópia de DNA do RNA do retrotransposon não LTR que pode ser integrado ao genoma em um novo local. Além disso, os retrotransposons não LTR se dividem em dois tipos: LINEs (elementos nucleares intercalados longos) e SINEs (elementos nucleares intercalados curtos).
Quais são as semelhanças entre retrotransposons LTR e não LTR?
- LTR e retrotransposons não-LTR são os dois principais tipos de retrotransposons.
- Ambos os tipos contêm genes para enzimas como transcriptase reversa, proteína de ligação a RNA, nuclease e domínios H de ribonuclease.
- Eles podem ser encontrados no genoma humano.
- Ambos os tipos são evolutivamente importantes.
Qual é a diferença entre retrotransposons LTR e não-LTR?
LTR retrotransposons têm longas repetições terminais em sua estrutura, enquanto retrotransposons não LTR não possuem longas repetições terminais em sua estrutura. Assim, esta é a principal diferença entre retrotransposons LTR e não LTR. Além disso, os retrotransposons LTR têm longas repetições diretas que são apenas uma sequência de bases se repetindo. Por outro lado, retrotransposons não LTR têm repetições curtas que podem ter uma ordem invertida de bases próximas umas das outras.
O infográfico abaixo apresenta as diferenças entre retrotransposons LTR e não LTR em forma de tabela para comparação lado a lado.
Resumo – Retrotransposons LTR vs Não-LTR
LTR e retrotransposons não-LTR são os dois principais tipos de retrotransposons. Os retrotransposons LTR têm repetições terminais longas em sua estrutura, enquanto os retrotransposons não LTR não têm repetições terminais longas em sua estrutura. Então, esta é a principal diferença entre retrotransposons LTR e não LTR.
