A principal diferença entre o CGH e o array CGH é que o CGH é um método citogenético molecular tradicional para analisar a variação do número de cópias no DNA de uma amostra de teste que tem uma resolução mais baixa, enquanto o array CGH é um método citogenético molecular totalmente automatizado para analisando a variação do número de cópias no DNA de uma amostra de teste que tem uma resolução mais alta.
CGH e array CGH são duas técnicas para detectar variações no número de cópias em indivíduos. A variação do número de cópias refere-se às seções do genoma que são repetidas. O número de cópias varia entre indivíduos. A variação do número de cópias é geralmente categorizada em dois grupos: repetições curtas e repetições longas. Um dos exemplos mais conhecidos para uma variação do número de cópias curtas é a repetição do trinucleotídeo CAG no gene da huntingtina. Isso causa um distúrbio neurológico chamado huntingtina. O melhor exemplo de variação do número de cópias de repetições longas é o gene alfa amilase, que causa resistência à insulina. A variação do número de cópias pode ser detectada por técnicas como FISH, CGH e array CGH.
O que é CGH?
CGH é um método tradicional de citogenética molecular para analisar a variação do número de cópias no DNA de uma amostra de teste em comparação com uma amostra de referência. Tem uma resolução menor em comparação com as técnicas automatizadas. O objetivo desta técnica é comparar de forma rápida e eficiente duas amostras de DNA genômico provenientes de diferentes fontes.
Figura 01: CGH
O procedimento envolve o isolamento do DNA de duas fontes: teste e referência. Em seguida, o próximo passo é a rotulagem independente de amostras de DNA teste e de referência com fluoróforos de cores diferentes. Mais tarde, as duas amostras de DNA foram desnaturadas para obter as amostras de DNA de fita simples. Finalmente, foi realizada a hibridização das duas amostras de DNA resultantes em uma proporção de 1:1 para uma disseminação metafásica normal de cromossomos. As diferenças cromossômicas podem ser identificadas entre as duas fontes usando um microscópio de fluorescência e software de computador. Além disso, a técnica CGH só é capaz de detectar anormalidades cromossômicas desequilibradas.
O que é Array CGH?
Array CGH é um método de citogenética molecular totalmente automatizado para analisar a variação do número de cópias no DNA de uma amostra de teste em comparação com uma amostra de referência. Possui maior resolução e foi desenvolvido para minimizar as limitações do CGH tradicional. Array CGH combina os princípios do CGH com o uso de microarrays. Em vez de usar cromossomos metafásicos espalhados, esse método usa lâminas dispostas com pequenos segmentos de DNA como alvos. Esses microarrays foram feitos depositando e imobilizando uma pequena quantidade de DNA (sondas) em um suporte de vidro sólido. O tamanho das sondas pode variar de oligonucleotídeo a um cromossomo artificial bacteriano.
Figura 02: Matriz CGH
Independentemente das sondas, o método básico de array CGH é semelhante ao CGH. Uma vez que as sondas contendo microarray são preparadas, as duas amostras de DNA (teste e referência) marcadas com fluoróforos de cores diferentes são misturadas e adicionadas ao microarray. Uma vez que o DNA nas amostras é de fita simples devido à desnaturação, esse DNA hibridiza com sondas de fita simples dispostas. Usando um sistema de imagem digital, é possível identificar as diferenças cromossômicas entre as duas fontes.
Quais são as semelhanças entre CGH e Array CGH?
- CGH e array CGH são duas técnicas para detectar variações no número de cópias.
- São métodos de citogenética molecular.
- Ambos os métodos diagnosticam anormalidades cromossômicas desequilibradas.
- Fluoróforos estão envolvidos em ambos os métodos.
- Ambos os métodos podem ser usados para detectar distúrbios genéticos devido a variações no número de cópias.
- Eles são amplamente utilizados em análises genômicas comparativas.
Qual é a diferença entre CGH e array CGH?
CGH é um método citogenético molecular tradicional para analisar a variação do número de cópias no DNA de uma amostra de teste que tem uma resolução mais baixa, enquanto o array CGH é um método citogenético molecular totalmente automatizado para analisar a variação do número de cópias no DNA de uma amostra de teste que tem uma resolução mais alta. Então, esta é a principal diferença entre CGH e array CGH. Além disso, em CGH, as amostras de DNA teste e de referência hibridizam com uma disseminação metafásica normal de cromossomos, mas no array CGH, as amostras de DNA teste e de referência hibridizam com as sondas de DNA imobilizadas contendo microarray.
O infográfico abaixo lista as diferenças entre CGH e array CGH em forma de tabela para comparação lado a lado.
Resumo – CGH vs Array CGH
CGH e array CGH são duas técnicas de citogenética molecular para detectar anormalidades cromossômicas desequilibradas. Eles são amplamente utilizados na análise genômica comparativa. CGH é um método tradicional de citogenética molecular para analisar a variação do número de cópias no DNA de uma amostra de teste que tem uma resolução mais baixa. Em contraste, o array CGH é um método de citogenética molecular totalmente automatizado para analisar a variação do número de cópias no DNA de uma amostra de teste que possui uma resolução mais alta. Assim, isso resume a diferença entre CGH e array CGH.
