A principal diferença entre FISH e CGH é que FISH é uma técnica molecular que detecta uma sequência de DNA específica em um cromossomo usando sondas marcadas com fluorescência, enquanto CGH é outra técnica citogenética molecular que detecta alterações no DNA genômico.
A análise citogenética desempenha um papel importante na medicina ao detectar anormalidades cromossômicas, como aneuploidias, deleções, duplicações e rearranjos, etc. As anormalidades cromossômicas eventualmente levam a doenças genéticas como câncer, infertilidade, síndrome de Down, síndrome de Klinefelter, Turner síndrome, leucemia, etc. Existem vários métodos de citogenética molecular para detectar os defeitos e doenças acima mencionados. Entre elas, FISH (hibridização in situ fluorescente) e CGH (hibridização genômica comparativa) são duas poderosas técnicas de hibridização. No entanto, ambos os métodos têm prós e contras.
O que é PEIXE?
FISH é uma técnica de hibridização de ácidos nucleicos realizada em uma porção ou seção de tecido, em todo o tecido ou células. É um método baseado em sonda. A técnica depende da teoria do emparelhamento de bases complementares de Watson Crick, resultando em híbridos DNA – DNA ou híbridos DNA – RNA, que podem detectar genes mutantes ou identificar o gene de interesse. Além disso, esta técnica usa sequências de DNA de fita simples, sequências de DNA de fita dupla, sequências de RNA de fita simples ou oligonucleotídeos sintéticos preparados usando tradução de nick como sondas que são complementares às sequências de genes de interesse. Além disso, a característica mais importante desta técnica é a marcação das sondas com corantes de fluorescência. Assim, as sondas se ligam às partes complementares do cromossomo e facilitam a detecção.
Além disso, FISH é um método altamente sensível e específico. Por isso, é uma técnica comum tanto na pesquisa quanto no diagnóstico de neoplasias hematológicas e tumores sólidos. Mas, FISH mostra baixa resolução. Também requer conhecimento prévio da anormalidade alvo para projetar sequências de sonda.
Figura 01: PEIXE
Existem muitas aplicações de FISH, principalmente no diagnóstico molecular de doenças infecciosas para identificar a presença de patógenos e confirmar o patógeno por meio de diagnóstico molecular. Além disso, FISH é uma técnica comumente usada nas áreas de biologia do desenvolvimento, cariotipagem e análise filogenética e mapeamento físico de cromossomos.
O que é CGH?
A hibridização genômica comparativa (CGH) é outra técnica citogenética molecular baseada em DNA que pode detectar as alterações das sequências de DNA genômico. O método é um método avançado que pode analisar modificações cromossômicas e genéticas para detectar as alterações ou alterações nas sequências de DNA genômico. Além disso, o CGH requer o isolamento e fragmentação do DNA da amostra experimental e da amostra de referência. Em seguida, as amostras devem ser rotuladas usando dois corantes fluorescentes diferentes (geralmente vermelho e verde). Mais tarde, ambas as amostras são misturadas e permitidas para hibridização competitiva. A etapa final é a análise das amostras quanto a alterações no DNA, como duplicação de genes, perda de genes, etc. Especialmente, mede as diferenças no número de cópias de DNA entre a amostra de teste e a amostra de controle.
Figura 02: CGH
Outra versão do CGH já está disponível; é um método mais avançado do que o CGH normal. É uma técnica chamada CGH baseado em array ou aCGH. aCGH permite a identificação precisa de deleções de genes ou sequências em milhares de sequências em um único experimento.
Quais são as semelhanças entre FISH e CGH?
- FISH e CGH são duas técnicas moleculares.
- Tanto FISH quanto CGH dependem da hibridização de ácido nucleico.
- Além disso, ambas as técnicas precisam de sondas projetadas para detectar alvos específicos de DNA.
- Usamos para diagnóstico pré-natal e pós-natal de doenças genéticas.
- Além disso, tanto FISH quanto CGH são ferramentas muito poderosas para estudar alterações genômicas.
- Eles usam corantes fluorescentes para rotular as sondas.
Qual é a diferença entre FISH e CGH?
FISH é um procedimento de hibridização in situ que utiliza sondas fluorescentes para detectar sequências específicas de DNA, enquanto a CGH é uma técnica de hibridização molecular que detecta as alterações de sequências de DNA genômico. Então, esta é a principal diferença entre FISH e CGH.
Além disso, o FISH requer conhecimento prévio da anormalidade alvo para projetar sequências de sonda, enquanto o CGH não requer conhecimento prévio. Além disso, uma outra diferença entre FISH e CGH é que FISH mostra resolução limitada enquanto aCGH mostra alta resolução.
O infográfico abaixo resume a diferença entre FISH e CGH.
Resumo – PEIXE vs CGH
FISH e CGH são duas técnicas de citogenética molecular que facilitam a detecção de sequências gênicas de interesse. O FISH facilita a detecção de sequências de DNA específicas em um cromossomo usando sondas marcadas com fluorescência, enquanto o CGH facilita a detecção de alterações no DNA genômico. Então, esta é a principal diferença entre FISH e CGH.