A principal diferença entre isoesquizômeros e neoesquizômeros é que isoesquizômeros são enzimas de restrição que têm a mesma sequência de reconhecimento e clivam o DNA nas mesmas posições, enquanto os neoesquizômeros são enzimas de restrição que têm a mesma sequência de reconhecimento, mas clivam o DNA em posições diferentes.
Enzimas de restrição ou endonucleases de restrição são enzimas que clivam o DNA em fragmentos em ou perto de locais de reconhecimento específicos. Eles cortam o DNA em locais de restrição. As enzimas de restrição são geralmente classificadas em cinco grupos com base na estrutura, se cortam seu substrato de DNA em seu sítio de reconhecimento e se os sítios de reconhecimento e clivagem são separados um do outro. Mais de 3600 endonucleases de restrição já foram identificadas. Aproximadamente 800 enzimas de restrição estão disponíveis comercialmente. Isosquizômeros e neoesquizômeros são dois tipos de enzimas de restrição com base no local de reconhecimento e especificidade de clivagem.
O que são isosquizômeros?
Isosquizômeros são enzimas de restrição que possuem a mesma sequência de reconhecimento e clivam o DNA nas mesmas posições. Estas enzimas de restrição têm a mesma especificidade. A primeira enzima de restrição descoberta que reconhece uma determinada sequência é conhecida como protótipo, enquanto todas as enzimas de restrição identificadas posteriormente que reconhecem essa mesma sequência são chamadas de isosquizômeros. No entanto, os isoesquizômeros podem diferir nas preferências do local, condições de reação, sensibilidade à metilação e atividade estelar. Os isosquizômeros são isolados de diferentes cepas de bactérias. Portanto, eles podem exigir diferentes condições de reação. Em alguns casos, apenas um de um par de isoesquizômeros pode reconhecer formas metiladas e não metiladas de sítios de restrição. Por outro lado, a outra enzima de restrição pode reconhecer apenas a forma não metilada do sítio de restrição. Esta característica particular dos isoesquizômeros ajuda a identificar o estado de metilação do sítio de restrição enquanto o isola de um estado bacteriano.
Por exemplo, AgeI e BshT1 reconhecem e clivam 5'-A↓CCGGT no mesmo padrão. HpaII e MSPI são outros pares de isoesquizômeros. Ambos reconhecem a sequência 5'-C↓CGG-3' quando não está metilada. Mas quando o segundo C da sequência é metilado, apenas MSPI pode reconhecer esta sequência enquanto HpaII não pode reconhecê-la.
O que são Neoesquizômeros?
Os neoesquizômeros são enzimas de restrição que possuem a mesma sequência de reconhecimento, mas clivam o DNA em posições diferentes. Em algumas aplicações especiais de biologia molecular, este é um recurso muito útil. Os neoesquizômeros são um subconjunto de isoesquizômeros. Exemplos bem conhecidos de neoesquizômeros são SmaI (5'-CCC↓GGG-3') e XmaI (5'-C↓CCGGG-3'); ambos reconhecem a sequência 5'-CCCGGG-3', mas os clivam em uma posição diferente. Assim, essas duas enzimas de restrição geram diferentes tipos de extremidades. Neste caso, SmaI produz extremidades sem corte e XmaI produz extremidades salientes de 5'.
Figura 01: Neoesquizômeros
Outro exemplo é o par de enzimas de restrição MaeII e Tail. O protótipo MaeII (A↓CGT) produz fragmentos de DNA com extensão 5' de 2 bases, e Cauda de neoesquizômero (ACGT↓) produz fragmentos de DNA com extensão 4-base3'.
Quais são as semelhanças entre isosquizômeros e neoesquizômeros?
- Isosquizômeros e neoesquizômeros são dois tipos de enzimas de restrição.
- Eles são predominantemente encontrados em procariontes.
- Eles fazem parte do sistema de modificação de restrição (RM) encontrado em bactérias e archaea.
- Ambos são moléculas de proteína.
- Ambos clivam o DNA em fragmentos.
Qual é a diferença entre isosquizômeros e neoesquizômeros?
Isosquizômeros são enzimas de restrição que possuem a mesma sequência de reconhecimento e clivam o DNA nas mesmas posições, enquanto os neoesquizômeros são enzimas de restrição que possuem a mesma sequência de reconhecimento, mas clivam o DNA em posições diferentes. Então, esta é a principal diferença entre isoesquizômeros e neoesquizômeros. Além disso, os isoesquizômeros têm as mesmas especificidades enquanto os neoesquizômeros têm especificidades diferentes.
O infográfico a seguir lista as diferenças entre isoesquizômeros e neoesquizômeros em forma de tabela para comparação lado a lado.
Resumo – Isosquizômeros vs Neoesquizômeros
Enzimas de restrição são enzimas de corte de DNA. Eles também são chamados de tesoura molecular. Existem diferentes tipos de enzimas de restrição. Com base no sítio de reconhecimento e na especificidade da clivagem, as enzimas de restrição são de dois tipos: isoesquizômeros e neoesquizômeros. Os isosquizômeros têm a mesma sequência de reconhecimento e clivam o DNA nas mesmas posições, enquanto os neoesquizômeros têm a mesma sequência de reconhecimento, mas clivam o DNA em posições diferentes. Assim, esta é a principal diferença entre isoesquizômeros e neoesquizômeros.
