Agarose vs Poliacrilamida
Agarose e Poliacrilamida são ambos polímeros solúveis em água, mas, entre eles, muitas diferenças podem ser observadas, começando pela sua origem. Tanto a agarose quanto a poliacrilamida têm algo em comum em sua capacidade de formar matrizes de gel poroso. Apesar disso, existem várias diferenças distintas entre os dois. As principais diferenças entre esses dois polímeros estão em sua natureza de origem, estrutura química, seus diferentes usos e seu desempenho em termos de eletroforese em gel.
O que é Agarose?
Agarose é um polímero linear de ocorrência natural que, por sua vez, é derivado de um polímero complexo chamado ágar encontrado em algas marinhas. A agarose é extraída do ágar pela remoção de seu componente proteico chamado agaropectina. Agarose é o que dá ao ágar sua capacidade de formar géis.
O principal uso da agarose é em estudos microbiológicos e de biologia molecular. Em estudos microbiológicos, a agarose, quando suplementada com nutrientes adequados, fornece uma base sólida para o cultivo de microrganismos como bactérias e fungos. Quando usado em concentrações semi-sólidas, pode ser útil na avaliação da motilidade desses microrganismos. Na biologia molecular, serve como uma ferramenta importante para um dos processos de resolução mais fundamentais, chamado 'eletroforese em gel' ou 'eletroforese em gel de agarose' (AGE). A eletroforese em gel é um processo que permite a resolução ou separação de ácidos nucleicos ou proteínas com base em seu tamanho e carga. Aqui, a agarose serve como um gel poroso semelhante a uma peneira através do qual a separação acontece.
Estrutura de Agarose
O que é Poliacrilamida?
A poliacrilamida é um polímero sintético e é usado em uma ampla variedade de indústrias. Como mencionado anteriormente, seu uso depende de sua capacidade de formar géis. No entanto, além disso, sua capacidade de reter e drenar água em diferentes concentrações também é explorada em várias indústrias.
O uso mais difundido e comum da poliacrilamida é no tratamento de águas residuais. Aqui, é usado como agente floculante para remover qualquer material orgânico em suspensão; assim, melhorando a turbidez e clarificando a água. Outro uso da poliacrilamida é na indústria de papel. Aqui, é usado para reter ou drenar a água da polpa de papel, conforme necessário. Da mesma forma, nas indústrias agrícolas e de construção, é usado como condicionador do solo para evitar a erosão do solo e melhorar sua qualidade.
Como agarose, a poliacrilamida também é usada em biologia molecular como uma importante ferramenta de resolução em um processo semelhante chamado 'Eletroforese em gel de poliacrilamida' (PAGE). Além de tudo isso, a Poliacrilamida também é utilizada no beneficiamento do minério e na fabricação de agente floculante para remover qualquer material orgânico em suspensão; assim, melhorando a turbidez e clarificando a água. Outro uso da poliacrilamida é na indústria de papel. Aqui, é usado para reter ou drenar a água da polpa de papel, conforme necessário. Da mesma forma, nas indústrias agrícolas e de construção, é usado como condicionador de solo para evitar a erosão do solo e melhorar sua qualidade. Além de tudo isso, a poliacrilamida também é usada na fabricação de aditivos alimentares, lentes de contato gelatinosas e têxteis.
Estrutura de poliacrilamida
Qual é a diferença entre Agarose e Poliacrilamida?
Origem da Agarose e Poliacrilamida:
Agarose: Agarose é um polímero de origem natural. É derivado de algas marinhas.
Poliacrilamida: A poliacrilamida é de origem sintética e não é encontrada em nenhuma circunstância natural.
Fórmula Molecular de Agarose e Poliacrilamida:
Agarose: A fórmula molecular da agarose é C24H38O19.
Poliacrilamida: A fórmula molecular da poliacrilamida é (C 3H5NO)n.
Estrutura Química de Agarose e Poliacrilamida:
Agarose: Agarose é um polissacarídeo linear. É composto de unidades repetidas de dissacarídeos chamadas agrobiose mantidas juntas por ligações de hidrogênio.
Poliacrilamida: A poliacrilamida é um polímero quimicamente reticulado. É composto de monômeros de acrilamida e um agente de reticulação N, N'-metilenobisacrilamida.
Toxicidade de Agarose e Poliacrilamida:
Agarose: Tanto a agarose quanto sua unidade monomérica agrobiose não são tóxicas por natureza.
Poliacrilamida: A unidade monomérica da poliacrilamida, a acrilamida, é um suposto carcinógeno e uma neurotoxina conhecida, embora sua forma polimerizada não seja de natureza tóxica.
Características dos géis de agarose e poliacrilamida:
AGE e PAGE:
Agarose: A preparação de gel de agarose para AGE é menos demorada, fácil e simples, e não requer um iniciador ou catalisador de polimerização.
Poliacrilamida: A preparação do gel de poliacrilamida para PAGE é demorada e tediosa e também requer um iniciador (persulfato de amônio) e um catalisador de polimerização (N, N, N', N'-tetrametiletilenodiamina – TEMED).
Natureza:
Os géis de poliacrilamida são quimicamente mais estáveis que os géis de agarose.
Tamanho do Poro:
Dada a mesma concentração, as matrizes de gel de poliacrilamida tendem a ter tamanhos de poros menores em comparação com uma matriz de gel de agarose.
Alteração do tamanho dos poros:
O tamanho dos poros dos géis de poliacrilamida pode ser alterado de forma mais controlada do que os géis de agarose.
Poder de Resolução:
Os géis de poliacrilamida têm alto poder de resolução, enquanto os géis de agarose têm baixo poder de resolução.
Acomodante de Ácido Nucleico:
Os géis de poliacrilamida podem acomodar maiores quantidades de ácido nucleico do que os géis de agarose para fins de resolução.
