A principal diferença entre ITS1 e ITS2 é que ITS1 é um DNA espaçador localizado entre os genes de rRNA 18S e 5.8S em eucariotos, enquanto ITS2 é um DNA espaçador localizado entre os genes de rRNA 5.8S e 28S em eucariotos.
Internal transcrited spacer (ITS) é o espaçador de DNA geralmente localizado entre o RNA ribossômico de subunidade pequena e os genes de RNA ribossômico de subunidade grande no cromossomo ou na região transcrita correspondente na molécula de transcrição do precursor de rRNA policistrônico. Em bactérias e archaea, existe apenas um único ITS entre os genes de rRNA 16S e 23S. Mas em eucariotos, existem dois DNA espaçadores ITS: ITS1 (entre 18S e 5.genes 8S rRNA) e ITS2 (entre 5,8S e 28S rRNA). Portanto, ITS1 e ITS2 são dois espaçadores de DNA encontrados entre genes de rRNA em eucariotos.
O que é ITS1?
ITS1 é um DNA espaçador localizado entre os genes rRNA 18S e 5.8S em eucariotos. ITS refere-se a um pedaço de DNA espaçador não funcional localizado entre os genes de rRNA. ITS1 tem uma variação de comprimento maior que ITS2. A variação de comprimento de ITS1 é aproximadamente (200-300bp). Marcadores ITS, como ITS1, provaram sua eficiência na elucidação de relações filogenéticas entre diferentes táxons. Além disso, o DNA espaçador ITS1 é menos conservado do que o DNA espaçador ITS2. As estruturas ITS1 são conservadas apenas em unidades taxonômicas muito menores. Cada aglomerado ribossômico eucariótico também contém regiões chamadas espaçadores transcritos externos (5' e 3' ETS).
Figura 01: região ITS1
O DNA do espaçador ITS1 está muito próximo do espaçador transcrito externo 5' (5' ETS). Além disso, se alguém quiser amplificar a região ITS1 para estudos de relação filogenética, deve usar um par de primers específico (reverse e forward primers) para esse fim. Para amplificar a região ITS1, normalmente são utilizados dois conjuntos de primers nos protocolos de PCR dos laboratórios. Eles são ITS1 direto e ITS2 reverso ou ITS1 direto e ITS4 reverso.
O que é ITS2?
ITS2 é um DNA espaçador localizado entre os genes de rRNA 5.8S e 28S em eucariotos. A região ITS2 tem uma variação de comprimento menor do que a região ITS1. A variação de comprimento de ITS2 é aproximadamente (180-240bp). No entanto, a região ITS2 é mais conservada do que a região ITS1 em muitas unidades taxonômicas. Ele identifica que todas as sequências ITS2 compartilham um núcleo comum da estrutura secundária. Além disso, 40% da região ITS2 é conservada entre todas as angiospermas, enquanto é possível alinhar 50% da região ITS2 na família e em nível superior.
Figura 02: região ITS2
Independentemente do escopo de conservação, o uso da região ITS2 também é muito popular, como a região ITS1, em estudos de relacionamento filogenético, especialmente em código de barras de DNA fúngico. Para amplificar a região ITS2, geralmente é utilizado um conjunto de primers específico nos protocolos de PCR dos laboratórios. Isso é ITS1 para frente e ITS4 reverso. Mas quando o protocolo de PCR usa esse conjunto de primers, ele também amplifica a região ITS1 junto com a região ITS2. Além disso, o DNA do espaçador ITS2 está muito próximo do espaçador transcrito externo 3' (3' ETS).
Semelhanças entre ITS1 e ITS2
- ITS1 e ITS2 são dois espaçadores de DNA localizados entre os genes de rRNA.
- Eles estão presentes apenas em eucariotos.
- Ambos podem ser amplificados usando pares de primers específicos.
- Ambos são excisados na maturação do rRNA como subprodutos não funcionais.
- Ambos são muito importantes para estudos de relacionamento filogenético, especialmente em código de barras de DNA fúngico.
Diferença entre ITS1 e ITS2
ITS1 é um DNA espaçador presente entre os genes de rRNA 18S e 5.8S em eucariotos, enquanto ITS2 é um DNA espaçador localizado entre os genes de rRNA 5.8S e 28S em eucariotos. Então, esta é a principal diferença entre ITS1 e ITS2. Além disso, o ITS1 apresenta maior variação de comprimento em relação ao ITS2. Por outro lado, ITS2 tem uma variação de comprimento menor em comparação com ITS1. Esta é outra diferença entre ITS1 e ITS2.
O infográfico abaixo lista as diferenças entre ITS1 e ITS2 em forma de tabela para comparação lado a lado.
Resumo – ITS1 vs ITS2
Região transcrita interna (ITS) é um pedaço não funcional de DNA espaçador localizado entre os genes de rRNA. Em bactérias e archaea, existe apenas uma única região ITS. Mas em eucariotos, existem duas regiões ITS: ITS1 e ITS2. ITS1 é um DNA espaçador que está localizado entre os genes de rRNA 18S e 5.8S em eucariotos, enquanto ITS2 é um DNA espaçador que está localizado entre os genes de rRNA 5.8S e 28S em eucariotos. Assim, este é o resumo da diferença entre ITS1 e ITS2.
