A principal diferença entre sintenia e colinearidade é que a sintenia é a co-localização física de loci genéticos no mesmo cromossomo em espécies, enquanto a colinearidade é a co-localização física de loci genéticos no mesmo cromossomo em diferentes espécies conservando a mesma ordem.
Synteny e colinearity são dois termos que são usados de forma intercambiável em genômica. Ambos os termos descrevem os padrões de localização de genes em cromossomos em diferentes espécies. Esses arranjos de genes relacionados entre os táxons são informações valiosas ao inferir a ancestralidade compartilhada dos genes. Synteny refere-se à co-localização física de loci genéticos no mesmo cromossomo na espécie. A colinearidade refere-se à co-localização física de loci genéticos no mesmo cromossomo em diferentes espécies conservando a mesma ordem. Portanto, é uma forma de sintania.
O que é Synteny?
Em diferentes espécies, existe um conjunto de genes localizados no mesmo cromossomo. E essa co-localização física de genes no mesmo cromossomo em diferentes espécies é conhecida como sintenia. Além disso, esses genes são encontrados muito próximos uns dos outros em um único cromossomo. A ordem dos genes pode não ser necessariamente a mesma. Mas, a localização de genes próximos uns dos outros no mesmo cromossomo ocorre em sintenia. Portanto, a sintenia descreve principalmente o padrão de distribuição de genes em um cromossomo. Esses padrões de co-localização de genes indicam relações entre diferentes espécies e sua evolução. No entanto, a sintenia pode ser interrompida devido a rearranjos cromossômicos, como translocações, inversão e fusão cromossômica, etc. duplicações, perda e recombinação homóloga desigual.
Figura 01: Sintenia
Acredita-se que todos os genes ligados sejam sintênicos. No entanto, nem todos os genes sintênicos estão necessariamente ligados. Eles possuem sequências cromossômicas comuns. Os seres humanos têm muitos genes sintênicos com outros mamíferos. Além disso, muitos cereais possuem genes sintênicos.
O que é Colinearidade?
Colinearidade é uma forma mais específica de sintenia na qual um conjunto de genes está localizado no mesmo cromossomo de diferentes espécies na mesma ordem da espécie ancestral. Portanto, se houver um desvio da colinearidade, será um caráter filogenético mais confiável, pois a colinearidade explica a ancestralidade compartilhada dos genes.
Figura 02: Colinearidade
A análise de colinearidade multivias fornece informações muito mais confiáveis sobre as espécies relacionadas e sua filogenia.
Quais são as semelhanças entre sintenia e colinearidade?
- Tanto na sintenia quanto na colinearidade, um conjunto de loci em duas espécies diferentes está localizado no mesmo cromossomo.
- Estes termos descrevem a co-localização física de loci genéticos no mesmo cromossomo.
- Colinearidade é uma forma mais específica de sintania.
- Às vezes, ambos os termos são usados de forma intercambiável na genômica.
- Se duas regiões têm colinearidade, elas são obviamente sintenosas.
- Eles são úteis para inferir filogenia.
Qual é a diferença entre sintenia e colinearidade?
Synteny e colinearity são dois termos que são usados de forma intercambiável em genômica. Synteny refere-se à co-localização física de um conjunto de genes no mesmo cromossomo em espécies diferentes. A colinearidade é uma forma de sintenia na qual o conjunto de genes é co-localizado na mesma ordem entre as diferentes espécies. Portanto, esta é a principal diferença entre sintania e colinearidade.
Resumo – Sintenia vs Colinearidade
Os termos sintenia e colinearidade referem-se a um conjunto de genes que estão localizados no mesmo cromossomo em espécies diferentes. Na verdade, esses genes estão co-localizados no mesmo cromossomo em diferentes espécies. Synteny descreve a co-localização física de conjuntos de genes no mesmo cromossomo em espécies diferentes, enquanto a colinearidade é uma forma mais específica de sintania na qual o conjunto de genes é co-localizado na mesma ordem. Assim, isso resume a diferença entre sintania e colinearidade.