A principal diferença entre CDS e ORF é que CDS é a sequência de nucleotídeos real de um gene que se traduz em uma proteína, enquanto ORF é um trecho de sequência de DNA que começa com o sítio de iniciação da tradução (códon de início) e termina com um local de terminação da tradução (códon de parada).
Um gene possui uma sequência de codificação (CDS). Consiste em éxons totais do gene e um códon de início e um códon de parada. É a parte real do gene que traduz e produz a proteína. A grelha de leitura aberta ou ORF é uma sequência de nucleótidos localizada entre um codão de iniciação e um codão de paragem. Não há códon de parada dentro de uma ORF interrompendo o código genético que se traduz em uma proteína. Em procariontes, CDS e ORF de um gene são os mesmos.
O que é CDS?
CDS ou sequência de codificação é a parte do gene que realmente se traduz em uma proteína. É composto por éxons e dois códons conhecidos como códon AUG e códon de parada. O CDS não contém duas regiões não traduzidas: 5' UTR e 3 UTR. Além disso, os íntrons não estão incluídos no CDS.
Figura 01: Sequência de Codificação
Quando comparado com todo o genoma de um indivíduo, as sequências de codificação são uma pequena fração. A sequência de codificação consiste na sequência de nucleotídeos necessária para formar a sequência de aminoácidos da proteína. Portanto, CDS são exons concentrados que podem ser divididos em tripletos de nucleotídeos ou códons. Os códons dão origem aos aminoácidos.
O que é um ORF?
Open reading frame ou ORF é o trecho contínuo de uma sequência de nucleotídeos que começa com um códon de início e termina com um códon de parada. Em palavras simples, ORF refere-se à região da sequência de nucleotídeos localizada entre os códons de início e fim. No meio, não há códon de parada interrompendo a ORF. A sequência de nucleotídeos entre o códon de início e o códon de parada codifica aminoácidos. Geralmente, o códon de início é ATG enquanto os códons de parada são TAG, TAA e TGA. ORF dá uma proteína funcional quando transcrita e traduzida. Assim, ORF inclui um códon de início, vários códons na região intermediária e um códon de parada. Curiosamente, ORF tem um comprimento que pode ser dividido por três.
Figura 02: Abrir Quadro de Leitura
Em procariontes, como não há íntrons, ORF é a sequência codificadora de um gene que transcreve diretamente em mRNA. Portanto, CDS e PRF são iguais em procariontes. Ao procurar genes em procariontes, é fácil detectar uma ORF e encontrar um gene em procariontes. Em eucariotos, uma vez que existem íntrons, ORF é a sequência de códons que se forma após o processamento ou splicing de RNA. ORF é uma evidência que auxilia na previsão de genes, desde que o ORF provavelmente seja parte de um gene.
Quais são as semelhanças entre CDS e ORF?
- Em procariontes, CDS e ORF são os mesmos.
- Ambos têm códon de início e códon de término.
- Eles têm um número de nucleotídeos que podem ser divididos por três.
- Uma vez traduzidos, eles produzem sequências de aminoácidos.
Qual é a diferença entre CDS e ORF?
CDS é a parte real do gene que se traduz em uma proteína, enquanto ORF é o trecho de DNA entre um códon de início e um códon de parada. Portanto, esta é a principal diferença entre CDS e ORF. Além disso, CDS não contém íntrons, mas ORF pode conter íntrons. CDS transcreve totalmente em uma sequência de mRNA completa, enquanto ORF pode ser uma parte da sequência de mRNA. Assim, esta é outra diferença entre CDS e ORF.
Abaixo o infográfico tabula lado a lado as diferenças entre CDS e ORF.
Resumo – CDS vs ORF
CDS e ORF são duas partes importantes de um gene. CDS refere-se à região real do DNA que se traduz em uma proteína. ORF é uma sequência de DNA que começa com o códon de início “ATG” e termina com qualquer um dos três códons de terminação (TAA, TAG ou TGA). ORF pode ser uma parte do mRNA completo de um gene. No entanto, a sequência de codificação de um gene transcreve para completar a sequência de mRNA. Todos os CDSs são ORFs. Mas nem todas as ORFs são CDSs. Assim, isso resume a diferença entre CDS e ORF.
