A principal diferença entre as sondas de DNA e RNA é que as sondas de DNA são fragmentos de DNA que são complementares às sequências de nucleotídeos alvo, enquanto as sondas de RNA são trechos de RNA de fita simples que são sequências de ácido nucleico complementares das sequências alvo.
Uma sonda é uma sequência curta de DNA ou RNA sintetizada artificialmente que pode ser marcada radioativamente ou com moléculas não radioativas. Pode ter um comprimento de 100 a 1000 bases. As sondas são úteis na detecção de sequências nucleotídicas alvo que são complementares à sequência da sonda. Uma vez adicionadas, as sondas são hibridizadas com as sequências complementares ou com as sequências alvo e as tornam visíveis para identificar as sequências alvo, pois carregam radioatividade. As sondas são ferramentas moleculares importantes para muitas áreas microbianas e moleculares, como detecção de doenças genéticas, virologia, patologia forense, testes de paternidade, impressão digital de DNA, RFLP, citogenética molecular, hibridização in situ, etc.
O que são Sondas de DNA?
As sondas DNA são trechos de DNA de fita simples. Eles podem ser usados para detectar a presença de sequências de ácidos nucleicos complementares (sequências alvo) por hibridização. Uma vez que uma sonda de DNA hibridiza com sua sequência complementar, ela forma um híbrido de fita dupla. Para detectá-los, as sondas de DNA são geralmente marcadas com radioisótopos, biotina, epítopos ou fluoróforos. As sondas de DNA marcadas com biotina podem ser detectadas com fosfatase alcalina marcada com estreptavidina por vários métodos enzimáticos e químicos.
Figura 01: Sonda de DNA
A sequência de nucleotídeos da sonda de DNA é conhecida. São sequências curtas com comprimento de 100 a 1000 pares de bases. Sondas longas de DNA podem ser geradas por tecnologia de DNA recombinante. Eles também podem ser gerados por PCR e clonagem. Nos laboratórios de microbiologia clínica, as sondas de DNA estão prontamente disponíveis para o diagnóstico rápido de doenças infecciosas.
O que são sondas de RNA?
As sondas de RNA são trechos de RNA de fita simples. São sequências complementares às sequências alvo na amostra. Eles são comumente sintetizados com as RNA polimerases dos bacteriófagos SP6, T7 ou T3 por transcrição in vitro de DNA. Sondas longas de RNA podem ser geradas por transcrição in vitro a partir de DNA de plasmídeo linearizado. Geralmente, as sondas de RNA ligam-se fortemente e mais firmemente às suas sequências complementares do que as sondas de DNA. Semelhante às sondas de DNA, as sondas de RNA também podem ser marcadas enquanto estão sendo transcritas.
Quais são as semelhanças entre as sondas de DNA e RNA?
- As sondas de DNA e RNA são sequências de nucleotídeos de fita simples.
- Ambos são projetados e sintetizados artificialmente.
- Além disso, eles podem ser marcados com radioisótopos, epítopos, biotina ou fluoróforos.
- Eles têm uma forte afinidade com uma sequência alvo específica de DNA ou RNA.
- Eles são usados em várias técnicas de blotting e hibridização in situ para a detecção de sequências de ácido nucleico alvo.
- Ambos os tipos de sondas podem ser hibridizados com suas sequências complementares.
- Eles também são usados na identificação de microrganismos e no diagnóstico de doenças infecciosas, hereditárias e outras.
Qual é a diferença entre as sondas de DNA e RNA?
A sonda DNA é um pequeno trecho de DNA que é complementar à sequência alvo. Por outro lado, a sonda de RNA é um pequeno trecho de RNA de fita simples complementar à sequência alvo. Assim, esta é a principal diferença entre as sondas de DNA e RNA. Além disso, as sondas de DNA contêm A, T, C e G, enquanto as sondas de RNA contêm A, U, C e G.
Além disso, uma outra diferença entre as sondas de DNA e RNA é sua estabilidade termodinâmica. As sondas de RNA mostram maior estabilidade termodinâmica em comparação com as sondas de DNA.
Abaixo o infográfico tabula as diferenças importantes entre as sondas de DNA e RNA.
Resumo – Sondas de DNA vs RNA
Uma sonda é um pequeno fragmento de DNA ou RNA usado para detectar a presença de uma sequência específica na amostra de DNA ou RNA por hibridização molecular. As sondas de DNA são fragmentos curtos de DNA de fita simples, enquanto as sondas de RNA são sequências curtas de RNA de fita simples. São sequências conhecidas. A estabilidade termodinâmica é maior nas sondas de RNA do que nas sondas de DNA. As sondas de RNA ligam-se firmemente às suas sequências complementares do que as sondas de DNA. Assim, isso resume a diferença entre as sondas de DNA e RNA.
