A principal diferença entre PCR de consenso e PCR pan é que PCR de consenso sempre tem como alvo regiões conservadas, enquanto Pan PCR tem como alvo regiões variáveis para identificar diferentes cepas de um grupo
A reação em cadeia da polimerase (PCR) é uma técnica de amplificação de genes que consiste em três etapas principais como desnaturação, hibridização e extensão. Isso é amplamente utilizado em diagnóstico e identificação molecular. As técnicas de PCR de consenso e PCR Pan são baseadas nos alvos de primer que cada tipo de PCR usa.
O que é PCR de consenso?
Consensus PCR é uma técnica de PCR que visa uma região conservada para uma espécie ou gênero particular. Portanto, regiões altamente conservadas são escolhidas para amplificação. Através deste método, os organismos podem ser identificados e distinguidos com base em seu consenso. Este método identifica uma região conservada para uma espécie particular. Por exemplo, a região 16s rRNA de bactérias permanece uma região conservada entre as bactérias. Portanto, apenas um conjunto de primers é necessário para a amplificação. Na maioria dos casos, um primer universal específico pode ser usado para a região conservada.
Figura 01: Técnica de PCR
Seguindo um método de PCR de consenso, a caracterização das espécies e as relações evolutivas podem ser deduzidas. Com base na eficiência de amplificação do organismo da amostra em particular, o consenso do organismo em relação ao grupo também pode ser deduzido. Além disso, a realização de uma PCR de consenso é vital em estudos filogenéticos. Permite a identificação de uma espécie e interpreta o desvio de um determinado organismo apresentado em termos do ancestral comum.
O que é Pan PCR?
A Pan PCR é um modo de multiplexação de PCR. Nesta técnica, diferentes cepas são amplificadas usando vários alvos de primer. Os alvos, no entanto, podem ser alvos comuns para os grupos de cepas. Assim, em Pan PCR, mais de dois conjuntos de primers podem ser usados ao mesmo tempo. Pode ocorrer em um método de reação de tubo único ou como um método de reação em vários tubos. Pan PCR é mais demorado e mais complexo em comparação com um PCR de consenso. Por esse motivo, a interpretação dos resultados da PCR também pode ser mais complexa na Pan PCR.
A principal aplicação do Pan PCR é no diagnóstico molecular. Permite distinguir entre diferentes estirpes de uma espécie por amplificação alvo. Pan PCR é uma técnica ideal para identificar diferentes cepas de uma única espécie causando uma doença. Na maioria dos casos, a automação de técnicas de Pan PCR para várias condições de saúde é muito importante e é uma técnica confiável e altamente eficiente.
Quais são as semelhanças entre PCR de consenso e PCR Pan?
- Consensus PCR e Pan PCR são dois tipos de técnicas de PCR.
- Ambos os procedimentos seguem o procedimento geral de três etapas – desnaturação, recozimento e extensão.
- Eles usam primers específicos para o alvo.
- Ambas as reações ocorrem em um termociclador.
- Estas reações podem ser automatizadas.
- Ambos podem ser usados em diagnóstico e identificação molecular; no entanto, a precisão varia.
- Estes procedimentos requerem validação.
Qual é a diferença entre PCR de consenso e PCR Pan?
Tanto Consenso quanto Pan PCR seguem o mesmo procedimento de rotina. No entanto, a principal diferença entre PCR de consenso e Pan PCR é baseada nos alvos do primer que cada procedimento utiliza. Enquanto a PCR de consenso sempre visa regiões conservadas, uma PCR Pan visa regiões variáveis para identificar diferentes cepas de um grupo. Devido a essa diferença, os protocolos de design de primers, o número de conjuntos de primers usados e as aplicações específicas variam.
O infográfico abaixo resume a diferença entre Consenso PCR e Pan PCR.
Resumo – PCR de consenso vs PCR Pan
PCR, introduzido por Mulli, desempenha um importante papel revolucionário em aplicações de biologia molecular. Consenso e Pan PCR são dois tipos de PCR com base em suas regiões alvo de primer. Enquanto a PCR de consenso tem como alvo regiões conservadas, a Pan PCR tem como alvo regiões variáveis e desempenha um papel importante na identificação de cepas. Devido a essa diferença básica entre PCR de consenso e Pan PCR, as funções específicas de cada tipo de PCR também variam desde a análise filogenética até a caracterização molecular e o diagnóstico molecular.
