Diferença chave – DNA upstream vs downstream
É importante ter um conhecimento geral sobre a composição e estrutura do DNA para entender a diferença entre DNA upstream e downstream. O DNA é composto de cadeias polinucleotídicas. Os nucleotídeos são os blocos de construção que criam cadeias de polinucleotídeos e cada nucleotídeo é feito de três componentes: um açúcar de cinco carbonos, uma base nitrogenada e um grupo fosfato. Um grupo fosfato e um grupo OH estão ligados ao carbono da posição 5' e carbono da posição 3' da molécula de açúcar em um nucleotídeo, respectivamente. Os nucleotídeos são unidos por ligações fosfodiéster formadas entre o grupo fosfato 5' de um nucleotídeo e o grupo OH 3' do nucleotídeo adjacente. Se uma cadeia polinucleotídica tem um grupo fosfato 5' livre, ele é designado como a extremidade 5'; se tiver um grupo 3' OH livre, é atribuído como uma extremidade 3'. Portanto, as fitas de DNA geralmente têm extremidades 5' e 3' de acordo com as posições finais das cadeias polinucleotídicas. O DNA também existe na forma de fita dupla. Duas fitas são antiparalelas entre si. Portanto, o DNA tem duas fitas que correm na direção 5' a 3' e na direção 3' a 5'. O DNA a montante e a jusante é referido com referência à transcrição e síntese de fita de mRNA de 5' a 3'. Se o DNA for considerado na extremidade 5 da fita codificadora do sítio de iniciação da transcrição, é conhecido como DNA upstream. Se o DNA é considerado na extremidade 3' da fita de codificação do local de iniciação da transcrição, é conhecido como DNA a jusante. Esta é a principal diferença entre o DNA upstream e downstream.
O que é DNA upstream?
Um gene é uma unidade hereditária estrutural e funcional que está localizada no DNA de um organismo. Ele é armazenado com instruções para construir uma proteína. O gene tem uma região específica de uma molécula de DNA. Quando necessário, ele transcreve e traduz em uma proteína por meio da síntese de uma fita de mRNA. Normalmente, uma fita codificadora do gene corre na direção 5' para 3'. Quando é transcrita, produz uma fita de mRNA na mesma direção 5' para 3'. Durante a transcrição, a fita antisense de 3' a 5' serve como fita molde e inicia a síntese de mRNA. Existe um sítio de iniciação da transcrição no gene. Com referência ao sítio de iniciação da transcrição, a região de DNA em direção à extremidade 5' da fita codificadora é conhecida como DNA a montante. Um promotor do gene está normalmente localizado na região a montante do DNA. Em genes eucarióticos, existem caixas TATA, elementos proximais do promotor e intensificadores na área a montante do gene. A região a montante do gene é referida com números negativos. O DNA upstream de um gene é de extrema importância para a transcrição.
O que é DNA a jusante?
O local de iniciação da transcrição é conhecido como +1 ponto de um gene. A região do DNA do ponto +1 em direção à extremidade 3' da fita codificadora é conhecida como DNA downstream. Em outras palavras, a jusante do gene é do local de iniciação da transcrição em direção à extremidade 5' da fita molde. Portanto, o DNA a jusante de uma região gênica inclui unidade de transcrição e outras sequências, como a sequência terminadora. O promotor pode influenciar a sequência a jusante de um gene. A parte a jusante de um gene é referida com números positivos. O DNA a jusante de um gene é a região real que fornece o produto proteico.
Figura 01: DNA a montante e a jusante
Qual é a diferença entre DNA upstream e downstream?
DNA Upstream vs Downstream |
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| A região do DNA em direção à extremidade 5' da sequência de codificação do sítio de iniciação da transcrição é conhecida como DNA upstream. | A região do DNA em direção à extremidade 3' da fita de codificação do local de iniciação da transcrição é conhecida como DNA a jusante. |
| Elements | |
| Promotores e potenciadores estão localizados no DNA upstream | A unidade de transcrição e as sequências de terminação estão localizadas no DNA a jusante. |
| Numeração | |
| Nucleotídeos na região upstream são referidos com números negativos | Nucleotídeos são referidos com números positivos. |
| Função | |
| Esta região contém elementos necessários para regular e iniciar a transcrição | Esta região contém instruções para produzir uma proteína e terminar a transcrição |
Resumo – DNA upstream vs downstream
É fácil identificar a montante e a jusante de uma fita de RNA. No que diz respeito ao sítio de referência, a região em direção à extremidade 5' da fita de RNA é conhecida como RNA a montante, enquanto a região em direção à extremidade 3' é conhecida como RNA a jusante. No entanto, no DNA, existem duas fitas que correm em ambas as direções 5' a 3' e 3' a 5'. Assim, a diferença entre o DNA upstream e downstream é complicada. Portanto, é diferenciado com referência à transcrição de um gene. Do sítio de iniciação da transcrição até a extremidade 5 da fita sense, a região do DNA é conhecida como DNA upstream, enquanto do local de iniciação da transcrição até a extremidade 3' da fita sense é conhecida como DNA downstream. Esta é a diferença entre upstream e downstream do DNA.
