A principal diferença entre a sequência de Shine Dalgarno e Kozak é que a sequência de Shine Dalgarno é um sítio de ligação ribossômica no RNA mensageiro bacteriano e arqueal, enquanto a sequência Kozak é um sítio de iniciação da tradução de proteínas na maioria dos RNAs mensageiros eucarióticos.
Shine Dalgarno e sequência de Kozak são duas sequências de consenso que são muito importantes para o início da tradução. Na biologia molecular, a tradução é o processo pelo qual os ribossomos no citoplasma sintetizam proteínas após o processo de transcrição. Na tradução, um mRNA (RNA mensageiro) é decodificado em um ribossomo para produzir uma cadeia de aminoácidos específica fora do núcleo. Normalmente, um ribossomo induz o processo de decodificação facilitando a ligação de sequências de anticódons de tRNA complementares a códons de mRNA. A tradução ocorre em três etapas: iniciação, alongamento e terminação.
O que é a sequência Shine Dalgarno?
Shine A sequência de Dalgarno é um sítio de ligação ribossômica em RNA mensageiro de bactérias e arqueias. Geralmente está localizado em torno de 8 bases a montante do códon de iniciação AUG. Essa sequência de RNA ajuda a recrutar ribossomos para o RNA mensageiro, alinhando o ribossomo com um códon de início de mRNA. Assim, ele inicia a síntese de proteínas. Uma vez após o recrutamento, o tRNA pode adicionar aminoácidos em sequência conforme ditado pelos códons do mRNA. Essa sequência especial é comum em bactérias, mas mais rara em archaea. Além disso, também está presente em transcritos de cloroplastos e mitocondriais. A sequência Shine Dalgarno foi proposta pela primeira vez pelos cientistas australianos John Shine e Lynn Dalgarno. A sequência de consenso de seis bases é AGGAGG. Por exemplo, em Escherichia coli a sequência é AGGAGGU.
Figura 01: Sequência Shine Dalgarno
A seleção do sítio de iniciação (AUG) depende da interação entre a subunidade 30S do ribossomo e o molde de mRNA. A região rica em pirimidina no componente 16srRNA da subunidade 30S liga-se à região rica em purina conhecida como sequência Shine Dalgarno a montante do códon de iniciação AUG no mRNA. Além disso, durante a formação do complexo de iniciação, essas sequências de nucleotídeos complementares se emparelham para formar uma estrutura de RNA de fita dupla. Isso facilita a ligação do mRNA a um ribossomo de tal forma que o códon de iniciação é colocado no sítio P do ribossomo.
O que é a Sequência Kozak?
A sequência Kozak é um sítio de iniciação da tradução de proteínas na maioria dos mRNAs eucarióticos. Essa sequência também é chamada de sequência de consenso de Kozak. A sequência de Kozak é a sequência ideal para iniciar a tradução em eucariotos. Esta sequência é um aspecto integral da regulação da proteína. Também é muito importante para a saúde celular geral. Ajuda a corrigir a tradução de proteínas a partir de mensagens genéticas mediando a montagem de ribossomos e a iniciação da tradução.
Figura 02: Sequência Kozak
Esta sequência recebeu o nome da cientista que a descobriu, Marilyn Kozak. Ela descobriu através de uma análise detalhada de sequências genômicas de DNA. A sequência Kozak é 5' (gcc) gccRccAUGG-3'. As letras maiúsculas indicam bases conservadas, enquanto as letras minúsculas indicam bases variáveis comuns. R indica uma purina (adenina ou guanina) que está sempre posicionada neste local.
Quais são as semelhanças entre Shine Dalgarno e Kozak Sequence?
- Shine Dalgarno e sequência de Kozak são duas sequências de consenso que são muito importantes na iniciação da tradução.
- Ambos são sequências de RNA.
- A subunidade menor do ribossomo se liga a ambas as sequências.
- Ambas as sequências medeiam a montagem adequada do ribossomo e a iniciação da tradução.
- Eles são aspectos integrais da regulação de proteínas e da saúde celular geral.
Qual é a diferença entre a sequência Shine Dalgarno e Kozak?
Shine A sequência de Dalgarno é um sítio de ligação ribossômica encontrado em RNA mensageiro bacteriano e arqueal, enquanto a sequência Kozak é um sítio de iniciação de tradução de proteína encontrado na maioria dos RNA mensageiro eucariótico. Então, esta é a principal diferença entre a sequência Shine Dalgarno e Kozak. Além disso, a sequência de Shine Dalgarno é 5'AGGAGGU3' enquanto a sequência de Kozak é 5' (gcc) gccRccAUGG-3'.
O infográfico a seguir lista as diferenças entre a sequência Shine Dalgarno e Kozak em forma de tabela para comparação lado a lado.
Resumo – Sequência Shine Dalgarno vs Kozak
As sequências Shine Dalgarno e Kozak são duas sequências de RNA de consenso que são muito importantes para a montagem de ribossomos e iniciação da tradução. A sequência de Shine Dalgarno é um sítio de ligação ribossômica no RNA mensageiro bacteriano e arqueal, enquanto a sequência Kozak é um sítio de iniciação da tradução de proteínas na maioria dos RNA mensageiros eucarióticos. Assim, isso resume a diferença entre a sequência Shine Dalgarno e Kozak.
