A principal diferença entre primer e promotor é que o primer é uma sequência curta de DNA sintetizada comercialmente que é usada em PCR para amplificação de uma sequência de DNA alvo, enquanto o promotor é uma sequência de DNA específica que fornece um local de ligação inicial seguro para o RNA polimerase e fatores de transcrição para iniciar a transcrição.
Primer e promotor são dois tipos de sequências de DNA. Primer é um pequeno fragmento de DNA necessário para a reação em cadeia da polimerase (PCR). Possui sequências curtas de nucleotídeos complementares à extremidade flanqueadora da fita de DNA. Existem dois tipos de primers, e eles funcionam como pontos de partida para a síntese de novas fitas de DNA. Em contraste, um promotor é uma sequência de DNA específica localizada a montante do sítio de iniciação da transcrição de um gene. Ele interage diretamente com os componentes do mecanismo de transcrição, como RNA polimerase e fatores de transcrição, a fim de controlar a transcrição do DNA. Portanto, a RNA polimerase e outros fatores de transcrição se ligam à sequência do promotor e iniciam a transcrição.
O que é uma cartilha?
Primers são sequências curtas de DNA projetadas para a amplificação de sequências de DNA alvo. Estruturalmente, eles possuem sequências curtas de nucleotídeos complementares às extremidades flanqueadoras das fitas duplas de DNA. Eles geralmente têm cerca de 20 nucleotídeos de comprimento. Durante a PCR, a Taq polimerase catalisa a adição de nucleotídeos na sequência de nucleotídeos preexistente. Assim, os primers servem como pontos de partida para a síntese de novas fitas. A Taq polimerase funciona apenas na direção de 5' a 3'. Assim, a síntese de DNA também ocorre na mesma direção 5' para 3'. Como o DNA é de fita dupla, dois tipos de primers são necessários na PCR. Eles são conhecidos como primer direto e primer reverso, com base na direção do alongamento do primer durante a síntese de DNA.
Figura 01: Primers
Forward primer hibrida com a fita de DNA antisense e inicia a síntese da fita + do gene na direção 5' para 3'. Possui uma sequência de nucleotídeos curta que é complementar à extremidade flanqueadora 3' da fita antisense. O primer reverso hibridiza com a fita sense e inicia a síntese de uma fita complementar da fita codificadora, que é uma fita do gene na direção 5' para 3'. Assim, o primer reverso é projetado complementar à extremidade 3' da fita de codificação. Ambos os primers reversos e diretos são importantes para a produção de milhões a bilhões de cópias de regiões específicas do DNA que são alvo ou interessadas.
O que é um Promotor?
O promotor é uma sequência de DNA localizada a montante ou na extremidade 5' do sítio de iniciação da transcrição de um gene. Ele fornece um sítio de ligação para a RNA polimerase e certos elementos reguladores para iniciar a transcrição do gene. É uma sequência reguladora necessária para ligar ou desligar um gene. Existe uma sequência nucleotídica específica no promotor. Pode ter 100-1000 pares de bases. O promotor mostra a direção da transcrição. Além disso, indica a cadeia de sentido que deve ser transcrita.
Figura 02: Promotor de um Gene
Existem três tipos de elementos promotores como promotor central, promotor proximal e promotor distal. O promotor central é a porção mínima do promotor necessária para iniciar a transcrição. Ele está localizado mais próximo ao códon de iniciação. A caixa TATA é uma região conservada encontrada em muitos promotores de núcleo eucarióticos. Encontra-se 25 a 35 pares de bases a montante do local de início da transcrição. O promotor proximal é encontrado mais a montante do promotor central. Geralmente, está localizado a 250 pares de bases a montante do códon de iniciação e contém elementos reguladores primários. O promotor distal encontra-se a montante do promotor proximal e contém elementos reguladores adicionais. Os promotores bacterianos têm dois elementos de sequência curta em seus promotores. TATAAT é a sequência de consenso localizada em -10 do promotor bacteriano enquanto TTGACA é a sequência de consenso em -35. Eles são conhecidos como elemento -10 e elemento -35.
Quais são as semelhanças entre o Primer e o Promotor?
- Primer e promotor são dois tipos de sequências de DNA.
- Eles consistem em sequências de nucleotídeos.
- Tanto o primer quanto o promotor são importantes para a expressão gênica.
Qual é a diferença entre primer e promotor?
Primer é uma sequência curta de nucleotídeos projetada para a amplificação do DNA alvo. Em contraste, o promotor é uma sequência de DNA reguladora específica encontrada a montante do sítio de iniciação da transcrição de um gene. Então, esta é a principal diferença entre primer e promotor. Os primers têm cerca de 20 pares de bases, enquanto o promotor pode ter 100 a 1000 pares de bases. Funcionalmente, os primers servem como sequências iniciais para a síntese da nova fita, enquanto os promotores controlam a transcrição do gene fornecendo sítios de ligação para a RNA polimerase e outros fatores de transcrição.
Além disso, um promotor é definido como a direção da transcrição e indica a cadeia de sentido de um gene. Estruturalmente, o primer é uma sequência curta de DNA de fita simples, enquanto o promotor é uma sequência longa de DNA de fita dupla.
O infográfico abaixo tabula mais comparações relacionadas à diferença entre primer e promotor.
Resumo – Primer vs Promotor
Primers são sequências curtas de nucleotídeos complementares às extremidades flanqueadoras da fita dupla do DNA alvo. Dois tipos de primers são usados em PCR. Eles servem como sequências de partida para a síntese de novas fitas. Os primers são projetados comercialmente e são sequências estáveis à temperatura. Por outro lado, o promotor é uma sequência reguladora de um gene localizado a montante do sítio de iniciação da transcrição. Os promotores controlam a transcrição de genes. Eles fornecem sítios de ligação para a RNA polimerase e fatores de transcrição para iniciar a transcrição. Assim, este é o resumo da diferença entre primer e promotor.
