Key Difference – VNTR vs STR
Os estudos de DNA têm imensa utilidade para entender e determinar relações filogenéticas, diagnosticar doenças genéticas e mapear genomas de organismos. Várias técnicas associadas à análise de DNA são usadas para a identificação de um gene específico ou de uma sequência de DNA em um pool de DNA desconhecido. Eles são conhecidos como marcadores genéticos. Marcadores genéticos são usados em biologia molecular para identificar a variação genética entre indivíduos e espécies. A repetição em tandem de número variável (VNTR) e a repetição em tandem curta (STR) são dois tipos de marcadores genéticos que apresentam polimorfismo entre os indivíduos. Ambos os tipos são DNA repetitivo não codificante que são repetições em tandem. Eles são organizados em uma forma de cabeça para cauda em cromossomos. VNTR é uma seção do genoma onde a sequência curta de nucleotídeos é repetida várias vezes. STR é outra seção de DNA dentro do genoma que é organizado como unidades de repetição consistindo de dois a treze nucleotídeos em centenas de vezes. A principal diferença entre VNTR e STR é o número de nucleotídeos em uma sequência de repetição. As unidades repetidas de VNTR consistem em 10 a 100 nucleotídeos, enquanto a unidade repetida de STR consiste em 2 a 13 nucleotídeos. VNTR e STR são amplamente utilizados em estudos forenses.
O que é VNTR?
Uma repetição em tandem é uma sequência curta de DNA que é repetida da cabeça à cauda em um locus cromossômico específico. Não há outra sequência ou nucleotídeo dentro da repetição em tandem. Existem vários tipos de repetições em tandem no genoma. VNTR é um tipo de repetição em tandem entre eles que possui unidades de repetição consistindo de 10 a 100 nucleotídeos. VNTR é um tipo de minissatélite. Essas repetições em tandem podem ser encontradas em muitos cromossomos. Eles estão intercalados no genoma humano e estão situados predominantemente nas regiões subteloméricas dos cromossomos.
VNTRs mostram polimorfismo de repetição em tandem entre os indivíduos. O comprimento do VNTR em um determinado local do cromossomo é altamente variável entre os indivíduos devido à variação no número de unidades de repetição organizadas nessa seção de DNA. Portanto, o VNTR pode ser usado como uma ferramenta poderosa na identificação de indivíduos e a análise VNTR é utilizada em muitos campos, incluindo genética, pesquisa biológica, forense e impressão digital de DNA. Os VNTRs foram os primeiros marcadores genéticos usados para quantificar o enxerto de transplante de medula óssea. Os VNTRs também foram os primeiros marcadores polimórficos usados em perfis de DNA em medicina forense.
Figura 01: Variação dos VNTRs em seis indivíduos
A análise de VNTR é realizada via polimorfismo de comprimento de fragmento de restrição seguido de hibridização do sul. Portanto, ele precisa comparativamente de uma grande amostra de DNA. A interpretação do perfil VNTR também é problemática. Devido a essas limitações, o uso de VNTR em genética forense foi limitado e foi substituído pela análise de STR.
O que é STR?
STR é uma seção de DNA altamente repetitiva que consiste em duas a treze unidades de repetição de nucleotídeos organizadas em tandem. STR é semelhante ao VNTR. Mas varia de VNTR do número de nucleotídeos em uma sequência de repetição e o número de repetições. STR é um tipo de microssatélite.
STR análise envolvida na medição do número exato de unidades repetidas. Os STRs são altamente variáveis entre os indivíduos, semelhantes aos VNTs. Os perfis STR diferem de pessoa para pessoa. Portanto, a análise de STR é usada em biologia molecular para comparar loci específicos no DNA de duas ou mais amostras. Portanto, os STRs são considerados poderosos marcadores genéticos em biologia molecular. Ele fornece uma excelente ferramenta para identificação de indivíduos devido ao seu alto grau de polimorfismo e comprimento relativamente curto.
Atualmente, os STRs são a ferramenta de polimorfismo genético analisado mais comumente usada em genética forense. A maioria dos casos forenses envolve análise polimórfica STR. Os loci STR estão espalhados por todo o genoma. Existem milhares de STRs localizados em cromossomos que podem ser usados em análises forenses. A análise STR não envolve polimorfismo de comprimento de restrição como a análise VNTR. A análise STR não corta o DNA com enzimas de restrição. Sondas específicas são usadas para anexar regiões desejadas no DNA e usando a técnica de PCR, os comprimentos do STR são determinados.
Figura 02: Variação de STR entre amostras
Quais são as semelhanças entre VNTR e STR?
- VNTR e STR são DNA não codificante.
- Ambas são repetições em tandem.
- Ambos apresentam polimorfismo entre os indivíduos devido à diferença no comprimento da seção de DNA.
- Ambos são usados como marcadores genéticos poderosos em impressões digitais de DNA e em estudos forenses.
Qual é a diferença entre VNTR e STR?
VNTR vs STR |
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| VNTR é um DNA repetitivo não codificante que possui uma sequência curta de nucleotídeos repetida em tandem. | STR é uma seção de DNA altamente repetitiva que consiste em duas a treze unidades de repetição de nucleotídeos organizadas em tandem. |
| Tamanho | |
| VNTRs são maiores que STRs. | STRs são menores que VNTRs. |
| Número de Nucleotídeos na Sequência Repetitiva | |
| A unidade de repetição de VNTR consiste em 10 a 100 nucleotídeos. | A unidade de repetição de STR consiste de 2 a 13 nucleotídeos. |
Resumo – VNTR vs STR
VNTR e STR são dois poderosos marcadores genéticos usados em biologia molecular, especialmente no campo da genética forense. VNTR é um tipo de minissatélite e STR é um microssatélite. VNTR e STR são DNA não codificante e altamente repetitivo. São repetições em tandem. A estrutura geral de VNTR e STR é a mesma. No entanto, o número de nucleotídeos na sequência de repetição e o comprimento são diferentes. VNTR tem seqüências repetidas consistem de 10 a 100 nucleotídeos. STR tem sequências repetidas consistindo de 2 a 13 nucleotídeos. Esta é a diferença entre VNTR e STR.
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