A principal diferença entre o xileno cianol e o azul de bromofenol é que em 1% de gel de agarose, o xileno cianol migra mais lentamente, enquanto o azul de bromofenol migra mais rápido.
Cianol de xileno e azul de bromofenol são importantes marcadores de cor que podem ser usados no monitoramento do processo de eletroforese em gel de agarose e eletroforese em gel de poliacrilamida.
O que é Xileno Cianol?
Xileno cianol é um marcador de cor eletroforético ou um corante de rastreamento. É útil no monitoramento do processo de eletroforese em gel de agarose e eletroforese em gel de poliacrilamida. Quando esta substância é misturada com a amostra, a concentração desta substância torna-se tipicamente cerca de 0.005% a 0,03%. Alguns sinônimos que podemos usar para xileno cianol incluem Acid Blue 147, xileno cianol, xileno cianol FF, xileno cianol FF, etc.
A fórmula química deste composto é C25H27N2NaO 6S2 A massa molar do xileno cianol é 538,61 g/mol. Esta substância pode migrar a uma taxa de cerca de 4 a 5 quilobases de fragmentos de DNA em géis de agarose a 1%. No entanto, isso depende do buffer que usamos. Normalmente, o xileno cianol em gel de poliacrilamida a 6% pode migrar a uma velocidade de fragmentos de DNA de cerca de 140 pares de bases. Por outro lado, pode migrar em eletroforese em gel de poliacrilamida 20% desnaturante a uma taxa de oligonucleotídeo de 25 bases.
A contagem de doadores de ligação de hidrogênio de xileno cianol é 2m, e a contagem de aceptor de ligação de hidrogênio é 8. A contagem de ligação rotativa deste composto pode ser dada como 7. A complexidade de xileno cianol pode ser descrita como 1120 graus. Tem uma contagem de estereocentro de ligação definida de 1.
O que é azul de bromofenol?
O azul de bromofenol é um indicador de pH útil que é útil como marcador de cor eletroforético e corante. Tem o nome químico 3’, 3”, 5’, 5”-tetrabromofenolsulfonftaleína, BPB. A fórmula química deste composto é C19H10Br4O5 S. A massa molar deste composto é 669,96 g/mol. É inodoro e sua densidade pode ser dada como 2,2 g/mL. Seu ponto de fusão é 273 graus Celsius, e seu ponto de ebulição é 279 graus Celsius. Podemos prepará-lo adicionando lentamente o excesso de bromo a uma solução quente de fenolsulfonftaleína em ácido acético glacial.
O azul de bromofenol é útil como indicador ácido-base na faixa entre pH 3,0 a 4,6. É capaz de mudar de amarelo em pH 3,0 para pH 4,6. Além disso, é uma reação reversível. Estruturalmente, o azul de bromofenol é semelhante à fenolftaleína.
Além disso, podemos usá-lo como marcador de cor para monitorar o processo de eletroforese em gel de agarose e eletroforese em gel de poliacrilamida. Esta substância pode carregar uma carga negativa em pH moderado, onde pode migrar na mesma direção do DNA ou proteína em um gel. A taxa de migração pode variar de acordo com a densidade do gel e a composição do tampão. No entanto, em um típico gel de agarose a 1% em 1 vez tampão TAE ou tampão TBE, esta substância migra na mesma taxa que um fragmento de DNA de cerca de 300 pares de bases.
Qual é a diferença entre xileno cianol e azul de bromofenol?
Xileno cianol e azul de bromofenol são importantes marcadores de cor. A principal diferença entre o xileno cianol e o azul de bromofenol é que em gel de agarose a 1%, o xileno cianol migra mais lentamente, enquanto o azul de bromofenol migra mais rápido.
Abaixo está um resumo da diferença entre xileno cianol e azul de bromofenol em forma de tabela para comparação lado a lado.
Resumo – Xileno Cianol vs Azul de Bromofenol
Xileno cianol e azul de bromofenol são importantes marcadores de cor usados no monitoramento do processo de eletroforese em gel de agarose e eletroforese em gel de poliacrilamida. A principal diferença entre o xileno cianol e o azul de bromofenol é que, no gel de agarose a 1%, o xileno cianol migra mais lentamente, enquanto o azul de bromofenol migra mais rápido.
