A principal diferença entre o isolamento do DNA genômico e do DNA plasmidial é que o isolamento do DNA genômico visa a extração do DNA genômico, enquanto o isolamento do DNA plasmídico visa a extração do DNA plasmidial da bactéria.
O isolamento de DNA é um processo químico usado para isolar o DNA de diferentes espécies ou de diferentes amostras. O isolamento de DNA é importante em técnicas de biologia molecular a jusante, como eletroforese em gel, reação em cadeia da polimerase e técnicas de sequenciamento de DNA. Portanto, o isolamento de DNA é um processo químico essencial em estudos de biologia molecular. Com base no objetivo da pesquisa, às vezes é necessário isolar o DNA genômico. Além disso, alguns estudos se concentram no isolamento de DNA plasmidial de bactérias. O isolamento de DNA genômico é o processo de isolamento de DNA genômico de uma amostra procariótica ou eucariótica. As etapas de isolamento diferem de acordo com o tipo de célula em que o DNA está isolando. O isolamento de DNA de plasmídeo é o processo de isolamento de DNA de plasmídeo de uma célula bacteriana. Em comparação com o isolamento de DNA genômico, o processo geral é complexo no isolamento de DNA de plasmídeo.
O que é isolamento de DNA genômico?
O isolamento de DNA genômico é o processo de extração de DNA genômico inteiro de um organismo. Este processo particular envolve três eventos principais. São eles, lise celular ou lise nuclear, degradação de proteínas ou proteólise e precipitação de DNA genômico. A etapa de lise pode diferir de acordo com o tipo de célula. Nos procariontes, como existe uma parede celular de peptidoglicano, o primeiro passo deve ser a quebra da parede celular. Por outro lado, em eucariotos, a etapa de lise envolve a quebra da membrana plasmática e da membrana nuclear para levar o DNA para o exterior. Em contraste, etapas especiais são essenciais para lisar as paredes celulares de plantas e fungos.
Figura 01: Isolamento de DNA genômico
Conseqüentemente, uma vez que a etapa de lise é concluída, eventualmente o DNA chegará ao sobrenadante. Simultaneamente, a degradação de proteínas também ocorre na solução devido à adição de proteinase K. O próximo passo é separar o DNA genômico e as proteínas degradadas umas das outras. Assim, as proteínas degradadas se separam por precipitação permitindo que o DNA genômico permaneça no sobrenadante. Após a precipitação das proteínas, o DNA genômico pode ser precipitado e ressuspenso em um tampão adequado até que seja necessário para o experimento.
O DNA genômico, que é o DNA linear, contém toda a informação genética de um organismo. Em outras palavras, o genoma é o material hereditário de um organismo vivo que é responsável por todas as atividades estruturais e funcionais da célula. Consiste em sequências de DNA codificantes e não codificantes. Ao isolar o DNA genômico, ele inclui todo o genoma do organismo.
O que é Isolamento de DNA Plasmídeo?
O isolamento de DNA de plasmídeo é um processo especial e mais complicado de isolamento de DNA. Os plasmídeos são DNA extracromossômico presente na maioria das células bacterianas. Eles são DNA circular adormecido que suporta as bactérias para sobreviver em condições ambientais adversas. O DNA de plasmídeo consiste em genes resistentes especiais que proporcionam vantagens adicionais às bactérias, como resistência a antibióticos, propriedades de virulência e propriedades tóxicas.
Figura 02: Isolamento de DNA plasmídico
O isolamento de DNA plasmídico também envolve três processos principais; lise celular, proteinólise e precipitação de DNA. Embora o mecanismo bioquímico de isolamento seja semelhante ao do isolamento do DNA genômico, o processo é mais complexo do que ele. O processo de lise celular é o processo mais importante neste procedimento. Mais importante ainda, o DNA genômico e o DNA plasmidial não devem ser misturados um com o outro. Portanto, um processo de lise muito mais suave é incorporado ao procedimento de isolamento de DNA de plasmídeo. Assim, na maioria dos procedimentos de isolamento de DNA de plasmídeo, use o detergente; dodecil sulfato de sódio para a lise celular.
Quais são as semelhanças entre DNA genômico e isolamento de DNA plasmídico?
- O isolamento de DNA genômico e DNA de plasmídeo se concentra na extração de DNA de um organismo.
- Além disso, ambos seguem o mesmo processo geral que inclui lise celular, degradação de proteínas e precipitação de DNA.
- Além disso, o DNA resultante de ambos os processos é importante para os processos posteriores.
- Além disso, ambos os processos de isolamento incluem as etapas para purificar e armazenar o DNA sob condições de armazenamento especificadas.
- Além disso, a proteinase K é usada em ambos os métodos para degradar proteínas.
Qual é a diferença entre DNA genômico e isolamento de DNA plasmídico?
O isolamento de DNA genômico se concentra na extração de DNA genômico inteiro do organismo alvo, enquanto o isolamento de DNA de plasmídeo se concentra em isolar apenas o DNA de plasmídeo da espécie bacteriana específica. Portanto, esta é a principal diferença entre o DNA genômico e o isolamento de DNA plasmidial. Além disso, outra diferença entre o DNA genômico e o isolamento do DNA plasmídico está no procedimento. O isolamento de DNA genômico é um procedimento menos complexo comparado ao isolamento de DNA plasmídico. Assim, ao isolar o DNA plasmidial, é necessário tomar precauções para evitar a mistura de DNA genômico e plasmidial entre si.
O infográfico abaixo fornece mais detalhes sobre a diferença entre DNA genômico e isolamento de DNA plasmidial.
Resumo – Isolamento de DNA genômico versus DNA plasmídico
O isolamento de DNA é um processo importante nas técnicas de biologia molecular. Existem dois tipos de DNA: DNA genômico e DNA plasmidial (DNA extra-cromossômico). Com base na exigência, alguns procedimentos são realizados para isolar o DNA genômico, enquanto outros se concentram em isolar apenas o DNA plasmidial de bactérias. Assim, as etapas envolvidas em ambos os processos diferem ligeiramente entre si. No entanto, o processo geral é o mesmo em ambos os isolamentos. O DNA isolado de ambos os processos tem imenso uso em processos a jusante, como clonagem, eletroforese em gel e reações em cadeia da polimerase. No final do protocolo de isolamento de DNA genômico, todo o DNA genômico do organismo pode ser isolado como produto final, enquanto no final do protocolo de isolamento de DNA de plasmídeo, o DNA de plasmídeo da respectiva bactéria pode ser isolado como produto final. Portanto, esta é a diferença entre DNA genômico e isolamento de DNA plasmidial.