Diferença entre genotipagem e sequenciamento

Índice:

Diferença entre genotipagem e sequenciamento
Diferença entre genotipagem e sequenciamento

Vídeo: Diferença entre genotipagem e sequenciamento

Vídeo: Diferença entre genotipagem e sequenciamento
Vídeo: As 4 gerações do sequenciamento 2024, Julho
Anonim

Key Difference – Genotipagem vs Sequenciamento

Genotipagem e sequenciamento são duas técnicas realizadas para obter informações sobre os ácidos nucléicos, principalmente o DNA de um organismo. A principal diferença entre genotipagem e sequenciamento é que a genotipagem é o processo de determinar qual variante genética o indivíduo possui usando marcadores, enquanto o sequenciamento é a determinação da ordem correta da sequência de nucleotídeos dentro de um determinado fragmento de DNA.

O que é Genotipagem?

Genotipagem é a determinação da composição genética de um indivíduo usando uma sequência de DNA e marcadores e comparação e identificação de sua herança. A genotipagem é importante na biologia evolutiva, biologia populacional, taxonomia, ecologia e genética dos organismos. Pode ser realizado por diferentes técnicas, incluindo sequenciamento de DNA, reação em cadeia da polimerase, polimorfismo de comprimento de fragmento de restrição (RFLP), detecção polimórfica amplificada aleatória, polimorfismo de comprimento de fragmento amplificado (AFLP), microarrays de DNA, etc.

A genotipagem envolve o sequenciamento de pequenos fragmentos particulares de sequências de DNA e a descoberta da relação da composição genética com outros indivíduos usando marcadores genéticos. Determina os polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) entre os indivíduos ou os alelos específicos. A genotipagem é aplicável a uma ampla gama de organismos, incluindo humanos. Também é aplicável a microorganismos como vírus, fungos etc. e pode ser usado para determinar suas variantes genéticas com os perfis de referência. Na epidemiologia molecular e microbiologia forense, o controle de patógenos, principalmente microrganismos, é feito pelas informações obtidas a partir da genotipagem. A genotipagem é muito importante na análise de pedigree. Os seres humanos são genotipados para confirmar a maternidade e a paternidade. O genótipo revelará os alelos dominantes e recessivos dos genes que decidem características específicas.

Diferença entre genotipagem e sequenciamento
Diferença entre genotipagem e sequenciamento

Figura_1: Genotipagem RFLP

O que é sequenciamento?

Sequenciamento é o processo de determinar a ordem correta do nucleotídeo em um determinado fragmento de DNA ou RNA. Praticamente todas as informações necessárias para o crescimento e desenvolvimento de um organismo estão codificadas em seu genoma. A disponibilidade de técnicas para produzir e separar algumas centenas de nucleotídeos de longos fragmentos de ácidos nucleicos levou ao desenvolvimento de procedimentos para determinar a sequência exata de nucleotídeos de um determinado fragmento de DNA ou RNA. Diferentes tipos de métodos de sequenciamento estão disponíveis hoje. Esses métodos de sequenciamento, juntamente com as tecnologias para construção de bibliotecas genômicas representando todo o genoma de um organismo, facilitam o sequenciamento de todo o genoma desse organismo, fazendo uma análise aprofundada das estruturas gênicas, funções gênicas, localizações gênicas, expressões gênicas, mapeamento de genes, regiões reguladoras de genes etc.

Os genomas totais de muitos vírus, várias bactérias, arqueobactérias, leveduras e vários outros organismos foram sequenciados e mapeados. O projeto genoma humano tornou possível sequenciar e mapear todo o genoma humano e publicar seu primeiro rascunho em 2003. É um marco importante no avanço da biologia. As sequências do genoma humano agora são usadas no setor médico para identificar causas genéticas de doenças raras, rastrear o risco de doenças em recém-nascidos, identificar detalhes genéticos de diferentes tipos de câncer, desenvolver novas terapias e desenvolver novas ferramentas de diagnóstico, etc.

No mundo vegetal, o genoma do arroz e os genomas de Arabidopsis foram sequenciados. O conhecimento dessas sequências sem dúvida revolucionará nossa compreensão de como as células e os organismos funcionam.

Diferença principal - Genotipagem vs Sequenciamento
Diferença principal - Genotipagem vs Sequenciamento

Figura_2: Uma autorradiografia do sequenciamento de sanger

Qual é a diferença entre Genotipagem e Sequenciamento?

Genotipagem vs Sequenciamento

Genotipagem é o processo de determinar a composição genética de um indivíduo e verificar o grupo ou a taxonomia desse organismo. Sequenciamento é o processo de determinar a ordem precisa dos nucleotídeos de um determinado fragmento de DNA ou RNA.
Técnicas
RFLP, sequenciamento de genes, PCR, microarranjos de DNA, AFLP etc. Sequenciamento Sanger, sequenciamento Gilbert, Pyrosequencing, Sequenciamento Next Generation, sequenciamento Shotgun etc.
Principais Preocupações
Isso está mais preocupado se as diferenças de genótipos estão dando as diferenças de fenótipos reais. Isso está mais preocupado com a ordem dos nucleotídeos e suas diferenças e mudanças com outros organismos.

Resumo – Genotipagem vs Sequenciamento

Genotipagem e sequenciamento são úteis para estudar a informação genética dos organismos. A genotipagem é o processo de determinar variações de genótipos entre indivíduos e encontrar suas categorias. O sequenciamento é o processo de determinar a ordem correta dos nucleotídeos no fragmento interessado ou na região do DNA. Ambas as técnicas fornecem informações importantes sobre os genes e genomas.

Recomendado: