A principal diferença entre metagenômica e metatranscriptômica está no tipo de biomoléculas estudadas em cada área. A metagenômica estuda o DNA, suas sequências e seu comportamento nos organismos, enquanto a metatranscriptômica estuda o DNA transcrito, principalmente as sequências de mRNA e seu comportamento nos organismos.
Metagenômica e metatranscriptômica são dois campos que ganharam muita popularidade ao longo dos anos em relação à comunidade microbiana. São importantes na área da saúde, indústria e biotecnologia agrícola. Tanto a metagenômica quanto a metatranscriptômica permitem o estudo de organismos individuais em uma comunidade e seus papéis funcionais que são benéficos ou prejudiciais.
O que é Metagenômica?
Metagenomics é o campo de estudo que explora o ácido desoxirribonucleico (DNA). É mais relevante para a comunidade microbiana. Além disso, é um campo mais avançado em comparação com a genômica. Na genômica, ocorre a análise do DNA de um determinado organismo. No entanto, a metagenômica envolve a análise de material genético em uma comunidade de organismos. Assim, isso permite estudar o comportamento de uma comunidade de organismos pertencentes a uma condição ou um ambiente.
Figura 01: Metagenômica
A principal técnica envolvida nos estudos de metagenômica é o Sequenciamento de Nova Geração (NGS) que utiliza a tecnologia de microarrays. Os métodos NGS podem analisar vários organismos em uma única reação quanto à presença ou ausência de sequências de DNA específicas. Essas sequências de DNA podem ser responsáveis por uma única condição de doença ou uma condição ambiental. Assim, usando o conhecimento metagenômico, a triagem de organismos pode ser feita com facilidade e precisão. O sequenciamento durante o NGS ocorre em leituras curtas e o perfil do DNA dos organismos ocorre. A sequência de DNA 16s é uma sequência popular estudada em metagenômica em relação a microrganismos.
Após o sequenciamento da comunidade de organismos, deve ser feito o alinhamento das sequências. Ferramentas como a ferramenta Basic Local Alignment Sequence (BLAST) estão em uso para cumprir a tarefa de alinhamento. Seguindo o alinhamento, uma árvore filogenética fornece o relacionamento de cada organismo na comunidade e detalhes sobre seu comportamento.
O que é Metatranscriptômica?
Metatranscriptômica é o campo de estudo que trata do transcriptoma de um organismo. O transcriptoma constitui todas as sequências de RNA transcritas durante a transcrição do DNA. As sequências de mRNA presentes no transcriptoma fornecem informações sobre a expressão genética. A metatranscriptômica é a análise de vários transcriptomas em populações ou comunidades.
Figura 02: Análise de Transcrição
Estudos de metatranscriptômica também usam tecnologias de microarrays para encontrar as sequências das sequências de leitura curta. Além disso, a metatranscriptômica também envolve uma análise completa de bioinformática usando ferramentas de alinhamento e métodos de design de árvores. No entanto, o campo da metatranscriptômica é muito mais difícil em comparação com a metagenômica. A extração de mRNA ou RNA como um todo não é tão fácil quanto parece. Como o RNA é altamente propenso à destruição e tem um tempo de vida muito curto, a manutenção e o armazenamento destes podem ser uma questão possível.
Quais são as semelhanças entre metagenômica e metatranscriptômica?
- A metagenômica e a metatranscriptômica são técnicas de alto rendimento para analisar comunidades de organismos, principalmente comunidades microbianas.
- Ambas as técnicas usam tecnologia de microarray para deduzir os resultados.
- Os resultados obtidos são frequentemente analisados usando alinhamento BLAST e árvores filogenéticas.
- Além disso, ambas as técnicas não se concentram em um organismo, mas em um grupo ou organismos comunitários.
- Além disso, ambos os conceitos também são estudados principalmente em relação aos micróbios – a principal razão são seus diversos papéis desempenhados.
Qual é a diferença entre metagenômica e metatranscriptômica?
Metagenômica e Metatranscriptômica envolvem a análise da matéria genética em uma comunidade de organismos. Assim, a metagenômica diz respeito aos padrões e sequências de DNA enquanto a metatranscriptômica se refere à análise do mRNA ou do DNA transcrito. Então, esta é a principal diferença entre metagenômica e metatranscriptômica.
Além disso, o procedimento de extração difere nas duas técnicas; a metagenômica envolve procedimentos de extração de DNA e a metatranscriptômica envolve procedimentos de extração de RNA. Portanto, essa também é uma diferença significativa entre metagenômica e metatranscriptômica.
O infográfico abaixo resume a diferença entre metagenômica e metatranscriptômica:
Resumo – Metagenômica vs Metatranscriptômica
Metagenômica e metatranscriptômica são novos campos de estudo que analisam uma comunidade de organismos para uma condição particular. Assim, metagenômica refere-se à análise de sequências de DNA. Em contraste, metatranscriptômica refere-se à análise de sequências de RNA ou produtos de DNA transcritos. Nesse sentido, a metatranscriptômica possibilita a identificação da expressão gênica para um caso particular. Ambos são importantes na análise de mutações e seus efeitos. São técnicas rápidas e mais confiáveis utilizadas no diagnóstico antecipado. Assim, este é o resumo da diferença entre metagenômica e metatranscriptômica.
