Diferença entre NGS e WGS

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Diferença entre NGS e WGS
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Vídeo: Diferença entre NGS e WGS

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Vídeo: WGS vs. WES 3: Two approaches to detecting mutations 2024, Outubro
Anonim

A principal diferença entre NGS e WGS é que o sequenciamento de próxima geração (NGS) é uma tecnologia de sequenciamento de segunda geração massivamente paralela com alto rendimento, baixo custo e rapidez, enquanto o sequenciamento de genoma completo (WGS) é um método abrangente de análise de todo o DNA genômico de uma célula de uma só vez usando técnicas de sequenciamento como sequenciamento Sanger, abordagem shotgun ou sequenciamento NGS de alto rendimento.

Nas últimas décadas, a compreensão do genoma de humanos e outros animais aumentou massivamente devido à descoberta de técnicas de sequenciamento rápido e ferramentas de bioinformática. As técnicas convencionais de sequenciamento, como o sequenciamento de Sanger, tinham suas limitações, o que exigia o desenvolvimento de novos métodos de sequenciamento rápido, como o sequenciamento de próxima geração (NGS) e o sequenciamento de nanoporos. A técnica de sequenciamento de genoma completo (WGS) é uma abordagem recente que já é utilizada em muitos projetos de pesquisa genômica, como o projeto 100.000 genomic da Genomic England, Reino Unido. Então, NGS e WGS são dois métodos de sequenciamento que estão sendo incorporados atualmente em muitos projetos genômicos.

O que é NGS?

NGS (sequenciamento de próxima geração) é uma tecnologia de sequenciamento de segunda geração massivamente paralela com alto rendimento, baixo custo e rapidez. Não há uma definição precisa para o sequenciamento de próxima geração. Mas podemos distingui-lo claramente das técnicas convencionais de sequenciamento capilar. O sequenciamento de última geração permite o sequenciamento de uma molécula de DNA com tamanho total maior que 1 milhão de pares de bases em um único experimento. Oferece velocidade sem precedentes e opções de alto rendimento, como permitir o sequenciamento de DNA de vários indivíduos ao mesmo tempo. Isto é conseguido miniaturizando o volume de reações de sequenciamento individuais. Além disso, isso também limita o tamanho dos instrumentos e minimiza o custo dos reagentes por reação.

NGS vs WGS
NGS vs WGS

Figura 01: Plataformas NGS

NGS é um método de sequenciamento de leitura curta que já revolucionou o campo da pesquisa biológica. Além disso, o NGS é aplicado em várias áreas, como sequenciamento de genoma de novo, sequenciamento de genoma completo, análise de transcriptoma, sequenciamento de RNA pequeno e microRNA, resequenciamento direcionado e sequenciamento de exoma inteiro.

O que é WGS?

WGS (sequenciamento do genoma inteiro) é um método abrangente de análise de todo o DNA genômico de uma célula de uma só vez usando técnicas de sequenciamento como sequenciamento Sanger, abordagem shotgun ou sequenciamento NGS de alto rendimento. Também é conhecido como sequenciamento completo do genoma ou sequenciamento completo do genoma. O sequenciamento de todo o genoma envolve o sequenciamento de todo o DNA cromossômico de um organismo, bem como o DNA nas mitocôndrias e, para as plantas, o DNA no cloroplasto de uma só vez. O WGS permite que os cientistas leiam a sequência exata de todas as letras que compõem o conjunto completo de DNA. Espera-se que o WGS usando a plataforma NGS revolucione a configuração clínica.

Sequenciamento de próxima geração vs sequenciamento de genoma completo
Sequenciamento de próxima geração vs sequenciamento de genoma completo

Figura 02: WGS vs Sequenciamento Hierárquico de Shotgun

O sequenciamento do genoma inteiro foi introduzido no atendimento clínico em 2014. Além disso, a aplicação do WGS envolve o sequenciamento de genes no nível do SNP para identificar variantes funcionais em estudos de associação, intervenção terapêutica em medicina personalizada, biologia evolutiva, análise genômica comparativa, estudos de mutações e rearranjos, estudos de associação de variantes raras e predição de suscetibilidade a doenças e resposta a medicamentos.

Quais são as semelhanças entre NGS e WGS?

  • NGS e WGS são duas técnicas de sequenciamento.
  • Ambas as técnicas sequenciam DNA ou RNA.
  • Estas técnicas são novas e confiáveis.
  • Ambos são usados no diagnóstico de doenças e na descoberta de medicamentos.

Qual é a diferença entre NGS e WGS?

NGS é uma tecnologia de sequenciamento massivamente paralela de segunda geração com alto rendimento, baixo custo e rapidez, enquanto o WGS é um método abrangente de análise de todo o DNA genômico de uma célula de uma só vez usando técnicas de sequenciamento como como sequenciamento Sanger, abordagem shotgun ou sequenciamento NGS de alto rendimento. Então, esta é a principal diferença entre NGS e WGS. Além disso, o NGS consiste apenas em métodos de sequenciamento de segunda geração, enquanto o WGS consiste em métodos de sequenciamento de primeira, segunda e terceira gerações.

A tabela a seguir apresenta as diferenças entre e NGS e WGS em forma de tabela para comparação lado a lado.

Resumo – NGS vs WGS

Nas últimas décadas, diferentes técnicas de sequenciamento têm sido rotineiramente aplicadas na pesquisa molecular contemporânea. E mesmo eles são ferramentas muito poderosas para muitas aplicações clínicas. NGS e WGS são dois métodos de sequenciamento que estão sendo incorporados em muitos projetos genômicos. O NGS é uma tecnologia de sequenciamento de segunda geração com alto rendimento, baixo custo e rapidez. Por outro lado, WGS é um método de análise de todo o DNA genômico ou DNA genômico completo de uma célula de uma só vez usando técnicas de sequenciamento como sequenciamento Sanger, abordagem shotgun ou sequenciamento NGS de alto rendimento. Então, este é o resumo da diferença entre NGS e WGS.

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