A principal diferença entre QTL e GWAS depende do tipo de sequências usadas na análise. QTL usa loci de genes de ligação para analisar características fenotípicas associadas à herança poligênica, enquanto GWAS usa sequências genômicas inteiras para analisar polimorfismos de nucleotídeo único de uma condição particular.
Mapas QTL e GWAS desempenham um papel importante nas análises genéticas para diferentes características. Além disso, eles são importantes na análise de várias doenças com etiologia desconhecida. Além disso, o sequenciamento desempenha um papel fundamental em ambas as técnicas. Essas técnicas podem ainda ser acopladas a outras técnicas de alto rendimento para maior exatidão e precisão.
O que é QTL?
QTL significa Quantitative Trait Locus. É uma região do DNA associada a uma característica fenotípica. Geralmente, um QTL dá origem a efeitos poligênicos. A distribuição dos QTLs varia, e o número de QTLs sugere o grau de variação de uma característica fenotípica particular. Além disso, eles normalmente codificam traços contínuos subjacentes e não traços discretos.
Ao identificar as regiões de QTL, é importante sequenciar uma determinada área de QTL. Além disso, para facilitar as investigações e pesquisas, o sequenciamento e o armazenamento dos dados de sequência das regiões QTL comuns ocorrem com o envolvimento da bioinformática. Chamamos essa técnica de mapeamento QTL. Subsequentemente, um banco de dados é construído com as sequências da região QTL.
Figura 01: Varredura QTL
Além disso, as aplicações das sequências QTL dependem principalmente da ferramenta BLAST, onde a similaridade das sequências pode ser determinada. É importante para deduzir as relações entre os organismos. Além disso, é importante para determinar a complexidade de um fenótipo poligênico particular. Também determina a evolução de uma característica particular.
Atualmente, a análise de QTL é combinada com outras técnicas de alto rendimento, como microarrays de DNA. Isso é importante na análise da expressão do fenótipo. Atualmente, os cientistas estão muito interessados em desenvolver o banco de dados QTL, uma vez que as regiões QTL são responsáveis por muitas características importantes de diferentes espécies.
O que é GWAS?
GWAS significa Genome Wide Association Study. Também se refere a estudos de associação do genoma completo. Esses estudos se concentram principalmente em estudos observacionais. Ele analisa as variantes genéticas de diferentes indivíduos geralmente associados a uma característica específica. Além disso, todo o genoma é importante para a análise GWAS.
Figura 02: GWAS
GWAS é uma ferramenta importante na análise de polimorfismos de nucleotídeo único associados a várias condições de doença. Este é também um estudo comparativo dos diferentes polimorfismos de nucleotídeo único em uma ampla população. Além disso, a amostra do estudo do GWAS é muito alta; portanto, também assume o formato de um estudo de coorte transversal.
Além disso, o primeiro estudo GWAS foi realizado em relação ao infarto do miocárdio e analisando os genes associados ao infarto do miocárdio. Atualmente, o GWAS desempenha um papel importante na determinação da base genética de doenças complexas com etiologia desconhecida.
Quais são as semelhanças entre QTL e GWAS?
- Eles contam com dados de sequências de DNA para a análise.
- Ambos estão associados aos antecedentes genéticos de vários personagens.
- Além disso, eles exigem ferramentas de bioinformática para deduzir e interpretar os resultados.
- Eles são feitos em grandes populações.
Qual é a diferença entre QTL e GWAS?
QTL analisa as características fenotípicas associadas à herança poligênica usando loci de genes ligados, enquanto GWAS analisa polimorfismos de nucleotídeo único de uma condição particular usando sequências genômicas inteiras. Assim, esta é a principal diferença entre QTL e GWAS. O mapeamento QTL é comparativamente uma técnica menos complexa do que o GWAS, pois requer o sequenciamento do genoma completo.
O infográfico abaixo resume a diferença entre QTL e GWAS em forma de tabela.
Resumo – QTL vs GWAS
Mapeamento QTL e GWAS desempenham um papel importante na determinação do fundo genético de várias características fenotípicas. Eles também ajudam na análise do fundo genético de diferentes doenças. O mapeamento de QTL mapeia os genes de ligação responsáveis por características contínuas e também envolve o mapeamento dos genes de herança poligênica. GWAS, por outro lado, ocorre com todo o genoma analisando polimorfismos de nucleotídeo único. Além disso, isso ocorre em uma população maior. Assim, este é o resumo da diferença entre QTL e GWAS.
