A principal diferença entre o encaixe molecular e a pontuação é que o encaixe é uma técnica usada para determinar a afinidade de ligação entre duas moléculas, enquanto a pontuação é um processo de avaliação de uma pose específica contando o número de interações intermoleculares favoráveis.
Os termos molecular docking e scoring são usados no campo da modelagem molecular. A modelagem molecular é uma técnica usada para determinar os possíveis arranjos de diferentes moléculas em uma determinada substância. Esta técnica é importante na criação de novos compostos estáveis.
O que é Docking Molecular?
Molecular docking é uma simulação computacional da ligação de um ligante candidato a um receptor. Este método prevê a orientação preferida de uma molécula para outra molécula quando ligadas uma à outra para formar um complexo estável. Os resultados obtidos com esta técnica podem ser usados para prever a força de associação ou afinidade de ligação entre duas moléculas. Aqui, a função de pontuação molecular também é importante.
Figura 01: Um Diagrama Simples mostrando o Processo de Interações Moleculares em Sistemas Biológicos
Geralmente, esta técnica considera as moléculas biologicamente relevantes, como proteínas, peptídeos, ácidos nucléicos, carboidratos e lipídios. Essas moléculas são muito importantes e desempenham um papel importante nos mecanismos de transdução de sinal em nosso corpo. Portanto, a orientação das duas moléculas que vão se ligar nesse processo de transdução de sinal afeta o tipo de sinal produzido aqui. Que significa; o encaixe molecular é importante para determinar a força e o tipo de sinal produzido durante a transdução de sinal em sistemas biológicos.
Além disso, as técnicas de ancoragem molecular são importantes no projeto de drogas baseadas em estrutura. Isso se deve à sua previsibilidade de conformação de ligação de pequenas moléculas, como ligantes, a um sítio de ligação adequado.
O que é Pontuação Molecular?
A pontuação molecular é um tipo de função matemática que é útil para avaliar o progresso do encaixe molecular. No campo da química computacional, as funções de pontuação são usadas para prever a afinidade de ligação entre duas moléculas após o processo de encaixe. Por exemplo, se tivermos uma pequena molécula de um fármaco em partículas e houver um alvo biológico como uma proteína, podemos avaliar a afinidade do fármaco em relação ao sítio de ligação. Além disso, a pontuação molecular pode ser usada para prever as interações intermoleculares entre duas proteínas ou entre uma proteína e moléculas de DNA.
Figura 02: Função de pontuação em resumo
A principal aplicação da pontuação molecular está nos processos de design de medicamentos - por exemplo, triagem virtual, design de novo, otimização de chumbo, etc.
Qual é a diferença entre encaixe molecular e pontuação?
Docking molecular e pontuação são importantes na modelagem molecular. A principal diferença entre o encaixe molecular e a pontuação é que o encaixe é uma técnica usada para determinar a afinidade de ligação entre duas moléculas, enquanto a pontuação é um processo de avaliação de uma pose específica contando o número de interações intermoleculares favoráveis.
O infográfico a seguir resume a diferença entre ancoragem molecular e pontuação.
Resumo – Ancoragem Molecular vs Pontuação
Docking molecular e pontuação são importantes na modelagem molecular. A principal diferença entre o encaixe molecular e a pontuação é que o encaixe é uma técnica usada para determinar a afinidade de ligação entre duas moléculas, enquanto a pontuação é um processo de avaliação de uma pose específica contando o número de interações intermoleculares favoráveis.
